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标题:【求助】western背景特异性强,抗体似有杂带...

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【求助】western背景特异性强,抗体似有杂带...

1.条件:
电泳:12%分离胶,3%浓缩胶,60v,120v各一小时;
转膜:PVDF膜0.45μm,300mA恒流湿转,按目的蛋白分子量大小计算转膜时间(1KD*1min,一般多10min左右)。内参使用GAPPDH,目的蛋白分子量大小分别为50KD,120KD.
一抗:用一抗稀释液稀释,santa(50KD,120KD各一个)的一抗按1:500稀释,abcam的(120KD一个)一抗按1:1000稀释。
二抗:国产中杉金桥,1:10000稀释,稀释液用5%的脱脂光明牛奶。
上样量大概在20μg左右
2.图片:
a:GAPDH跑的还可以:


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2013-11-15 17:08
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b:50KD的目的蛋白(santa)一直不大理想,一抗比例试过1:200,1:500,1:800,最后在1:500感觉能看到条带


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但是,背景一直都有非特异性染色,我用5%脱脂牛奶封闭2h,37度,也用过BSA4度过夜封闭,均是如此。下图是这两天做的,分别用10%脱脂牛奶(右)和5%封闭(左)的效果,而且这次感觉有杂带


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c:12KD的目的蛋白这次貌似只爆出了marker,想要的地方全是白板。之前倒是爆出来过的,但也是有的有,有的没有。

肿么办呀?请对western有经验的前辈不吝指教,多谢了!!!


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a图还好。
b图的第一个图算是曝出条带了,但是有纵向的杂点,应该是膜没有洗干净或SDS-PAGE时的SDS有析出(很少见)
b图的第二个图杂带多,但貌似也爆出来了。估计是两个方面的原因,1:抗体的质量问题,看看你的santa的说明书,看那上面示意图是什么样子的,也有杂带吗?2:最好能有阳参的样本一起做WB。
c图没有爆出来,个人感觉是因为转膜的时间太短,您可以用200mA恒流转3h试试120kD的蛋白。还虽然ABCAM
的抗体效价好,但一开始用1:1000也太稀了点吧(况且你的二抗是1:10000)?
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QUOTE:
原帖由 babybabe 于 2013-11-15 17:09 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
a图还好。
b图的第一个图算是曝出条带了,但是有纵向的杂点,应该是膜没有洗干净或SDS-PAGE时的SDS有析出(很少见)
b图的第二个图杂带多,但貌似也爆出来了。估计是两个方面的原因,1:抗体的质量问题,看看你的santa的说明书,看那上 ...

谢谢您的回复,我会改进一下实验条件。
另外,120KD的目的蛋白我现在用的是300mA恒流130~140min,您是不是以前用过120mA恒流转120KD的蛋白呀?abcam抗体说明书上建议一抗1:1000,您觉得多少稀释多少比例合适?二抗的浓度也低了吗?
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a 带出来了 但不齐

b 你是用santa的兔抗还是鼠抗 兔抗的话 首先考虑 抗体不行
santa的兔抗很坑爹
c abcam的抗体因为很多做代工 现在也慢慢坑爹了

问题可能的原因
1.抗体问题
2.蛋白表达量怎么样
3.wb步骤是否合理 100v 2h可以把你这几个蛋白都转上了
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a感觉不匀,不知道是你转膜的原因还是probe的原因,或者样品本身就不一样多
b竖着的条带是因为一抗的原因,没办法,换一个吧,其实也不影响你的结果
c
感觉你的目的蛋白浓度不高,尽量多点一些吧,你看人家santa的sample图例里面很多都用了50ug左右的total protein吧一抗浓度1:500差不多,二抗适当升高一些,还有就是你在incubate的时候尽量多放一点buffer和antibody,咋说要让膜均匀的泡在里面另外,如果你用commercial的ECL kit来曝光的话可能能增加你的信号强度
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a 带出来了 但不齐

b 你是用santa的兔抗还是鼠抗 兔抗的话 首先考虑 抗体不行
santa的兔抗很坑爹
c abcam的抗体因为很多做代工 现在也慢慢坑爹了

问题可能的原因
1.抗体问题
2.蛋白表达量怎么样
3.wb步骤是否合理 100v 2h可以把你这几个蛋白都转上了

============================================================================================

谢谢拉。
针对您的问题
1.b图分子量为50KD的是santa的兔抗,我已经向试剂商投诉了,不知道后面结果怎样。
c中两个120KD分子量的目的蛋白,一个是abcam的鼠抗,一个是santa的鼠抗。是不是santa的背景做出来一般都比较深?
2.50KD的蛋白表达量还比较高,120KD的比较少,所以下一步只能增大上样量了,但是我之前提的蛋白浓度比较低。唉~
3.您说的是转膜条件用100v恒压转2h?我现在的实验室都是恒流的,还没有用过您这种方法
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a感觉不匀,不知道是你转膜的原因还是probe的原因,或者样品本身就不一样多
b竖着的条带是因为一抗的原因,没办法,换一个吧,其实也不影响你的结果
c
感觉你的目的蛋白浓度不高,尽量多点一些吧,你看人家santa的sample图例里面很多都用了50ug左右的total protein吧一抗浓度1:500差不多,二抗适当升高一些,还有就是你在incubate的时候尽量多放一点buffer和antibody,咋说要让膜均匀的泡在里面另外,如果你用commercial的ECL kit来曝光的话可能能增加你的信号强度

===================================================================================

谢谢您的回答:)
a.深浅不均可能是因为样品本身的原因,我用了统一的上样体积,没有调整总上样量
b.我已经准备换抗体了。另:您是指这种竖着的条带不影响结果?但是我用的Image J不大好进行灰度分析。
c.看了这么多建议,我只能增加上样量了。。
ps:二抗1:8000可以吗?
pps:c中孵一抗的时候我一个是1:1000(abcam),一个是1:500(santa)
ppps:曝光的时候我用的是碧云天的ECL发光液,应该是您说的commercial的了吧?
我现在觉得每一步都是壁垒啊,处处都是问题。。。
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