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标题:【讨论帖】WESTERN疑难问题汇总

zzzz[使用道具]
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1
 

【讨论帖】WESTERN疑难问题汇总


WESTERN的过程中总是出现很多难以解决的疑难,影响了实验进程。希望大家提出一些实际的疑难,然后再进行解答,大家写出自己的经验,可以大家比较经验,互相学习:
1. 盖保鲜膜时,许多时候导致荧光淬灭,怎么解决
2.如何尽量提高蛋白浓度,具体裂解液 ,步骤
3 转膜后,丽春红染色,为什么泳道上染出的蛋白都是竖条纹的,是提蛋白不好还是其它原因吗 对结果会有什么样的影响
4 暗室中曝光,是肉眼看到荧光好还是看不到好 ,看不到条带曝多长时间比较好
5 为什么ACTIN条带很好看,而大分子的目的条带总是没有成形的好条带,有可能是蛋白被破坏了吗?或是蛋白提得不好吗?
6 如何正确的浇ECL 具体浇多少量,多长时间,可以曝后再反复浇吗
7 为什么有时候背景非常高,怎么调也调不掉,
8 如何高效率的摸抗体条件

谢谢大家的支持,为了使大家实验能够高效快速,能不能大家写得 具体一点,具体的 数据, 步骤, 配方 和 举例 等等 我改天也会补充的
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zzzz[使用道具]
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2
 

关于1,我们是这样解决的,我们不盖保鲜膜,直接曝光,但为了不让胶片和膜直接接触,我们自做了一个装置,是中空的,中间正好可以放入膜,上面有一个透明的硬塑料膜,但由于是中空装置,所以不会直接接触膜,曝光时,胶片盖在硬塑料膜上,减少了很多不必要的淬灭,条带恒定持久,而且结果也比较准确。
不知道大家是怎么解决的
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zzzz[使用道具]
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3
 

关于4,我认为在暗室中能够看到荧光比较好,但有时候看不到荧光我就放弃了,但听其他战友说,看不到荧光也可以曝,而且条带也比较好看,但我们从来没有在没有荧光下,曝出来条带。看不到荧光时,该怎么曝呢
大家认为呢
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zzzz[使用道具]
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4
 

关于7,
有好几种情况:
1. 一抗浓度比较高
2. 二抗浓度比较高
3. 洗膜时间不够,或TWEEN-20的量比较少
4. 还有可能是,胶的问题,有一次我们ACR 配得不好,怎么做都有背景,后来重配了ACR就好了

有没有可能是提蛋白的问题呢? 提蛋白时应该注意些什么问题呢?
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5
 
关于4,个人觉得当然是看到有荧光条带更好,最少让人觉得更有底气,但是有时候没有看到也并非一定没有结果.
因为:即使除了主观的原因外,没看到荧光也并不说明一定就没有抗体结合上去.我的个人实践为我证明了这一点.至于如何调整曝光时间,个人观点:先给予2-3min的曝光,再根据洗出来的胶片情况进行调整;如果背景及条带深,则减少曝光时间,反之则相应增加曝光时间,不过一般是要经过比较长的曝光时间进行曝光的,我曾经有一次曝了好几次都没有东西,最后死马当活马医治,曝了差不多30min,后来洗出来的胶片,看到了条带.
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abc816[使用道具]
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请问我用的是10%的分离胶,4%的浓缩胶,跑marker时候老是只能跑出六条带,而marker下面的34KD和26KD跑不出来,而我的蛋白分子量是34.27KD,请问这是为什么?我用的marker是fementes的可以跑10条带的
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雪花子[使用道具]
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7
 

问题7也是困惑了我好久的问题,我的蛋白21KD,转膜用0.22孔径的PVDF膜,在暗室里可见整张膜都特别亮,结果暴出来的片子很快就黑了,目的蛋白的条带就显得很弱,我曾经试过的改进办法:
1.原来用5%脱脂奶粉封闭改为3%BSA封闭;
2.封闭条件由37度封闭一小时改为4度过夜;
3.一抗,二抗洗膜条件为TBST洗3次,每次15分钟;
4.缩短暴光时间,显影时间
高手帮忙分析还有什么原因
楼上战友还提到ACR 配得不好会有影响,请问是什么样的影响?谢谢
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ritou1985[使用道具]
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8
 

4 暗室中曝光,是肉眼看到荧光好还是看不到好

这是一个伪命题,没做过western的人也应该知道是看到荧光好,建议楼主把问题改为“暗室中曝光,肉眼看不到荧光怎么办”。

我个人的经验是,看到荧光的,比如内参、HSP、BiP等高表达蛋白,一般曝光15-30 s,条带非常清晰漂亮。
如果看不到荧光,可以从几个方面解决:
1.ECL接触时间延长到2min
2.适当提高蛋白丄样量
3.适当提高一抗二抗浓度
4.提高曝光时间。

没有荧光,提高曝光时间,很多时候能得到条带。但如果时间过长,膜背景会比较脏。如果延长时间没有用,可以考虑1,2,3
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ritou1985[使用道具]
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6 如何正确的浇ECL

加ECL的关键是让整条膜能均匀接触到ECL,尤其是要注意膜的两侧也要完全接触ECL。此外,个人经验是最好AB液混合好以后再放入膜,千万不要单独接触膜,尤其是B液
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ritou1985[使用道具]
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2.如何尽量提高蛋白浓度
这个相对简单:如果你对提取的蛋白无特殊要求,用超声破碎细胞得到的蛋白丰度很高。
如果用裂解液,也可以裂解配合冻融,蛋白量也可以搞点。
还有,裂解液要放合适,不要太多(当然也不能太少)。

蛋白浓度不是高就好,只要够用就行。
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