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标题:【求助】同样条件,为什么我的蛋白没转到膜上呢?

applebook=213[使用道具]
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【求助】同样条件,为什么我的蛋白没转到膜上呢?


我做了两次wesern blot,没有结果,而且现在我也不知道问题在哪,所以没法继续做,请大家指教!

我检测的两个蛋白分别是Slit2和robo1(125 kDa),买的一抗是santa cruz的,二抗是实验室公用的,应该没问题。

第一个问题:

slit2的一抗说明书APPLICATIONS部分写着

“Molecular Weight of full length Slit2: 200 kDa.
Molecular Weight of Slit2 N-terminal cleavage fragment: 140 kDa.
Molecular Weight of Slit2 C-terminal cleavage fragments: 55-60 kDa.”

这是不是代表我的抗体能够识别slit2的全片段、N和C末端呢?

下面简述实验过程:

上样总蛋白每孔60ug左右

浓缩胶5%,恒压100V,50min

分离胶8%,恒压150V,40min

第一次转膜条件如下:

actin转膜350mA,70min

目的蛋白转膜350mA,150min(切胶的时候是从120到250切在一块)

结果:actin 条带清晰,余未见任何条带

然后用考马斯亮蓝染转过膜的胶显示:actin 42 kDa处以上和以下都可以见条带,尤其是在55 kDa处见明显的条带

目的蛋白那块胶上见几条细细的条带

用丽春红染膜,只见actin的位置处有条带

考虑转膜时间不够

第二次转膜改变条件如下

actin转膜350mA,100min

目的蛋白转膜350mA,210min(切胶的时候是从120到250切在一块)

结果:跟上次的结果一样,actin 条带清晰,余未见任何条带

然后用考马斯亮蓝染转过膜的胶显示:actin 42 kDa处以上和以下都可以见条带,在55 kDa处仍能见明显的条带

目的蛋白那块胶上见几条细细的条带

用丽春红染膜,只见actin的位置处有条带

但是同实验室的同学50-60 kDa,转膜都只用90min,结果很好,为什么我们用的同样的机子(北京六一电泳仪),同样的电泳液和转膜液,我用了100min,55kDa处的蛋白都转不上去呢?而且第二次延长转膜时间后,结果跟第一次没有任何变化?只是单纯的转膜时间不够吗?我的转膜时间好像也不短了。还是有其他的问题?

请大家帮帮忙,谢谢了
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BUK[使用道具]
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可能你所看见的你认为的目的条带并不是真正的目的条带 可能是其他蛋白的目的条带 不知道你那个蛋白表达情况怎么样 如果是表达量少 很有可能是转过头了
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applebook=213[使用道具]
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转过头应该可能性比较小,因为我放了两张膜,第二张膜上上连marker都没看到呀。而且我是转过膜后的胶考染后能见条带,而膜无论是加抗体发光还是丽春红染色都未见条带。我的疑惑是,先不讨论胶上的蛋白是不是我的目的蛋白,但是以我这种情况是不是可以说那个大小的分子并没有转膜成功。但是我的转膜时间不短了,同实验室的人同样条件又能转上去,这是为什么呢?

请大家多给点建议,指点下迷津啊
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slit2的一抗说明书APPLICATIONS部分写着

“Molecular Weight of full length Slit2: 200 kDa.
Molecular Weight of Slit2 N-terminal cleavage fragment: 140 kDa.
Molecular Weight of Slit2 C-terminal cleavage fragments: 55-60 kDa.”

这是不是代表我的抗体能够识别slit2的全片段、N和C末端呢?

==============================================================================================================

我帮你查询了下,santa cruz的几份针对不同片段的anti-slit2说明书都有这么段话,即,不仅target internal region OR C-terminal fragment。例如,cuturl('http://www.scbt.com/datasheet-16619-slit2-e-20-antibody.html')和cuturl('http://www.scbt.com/datasheet-26601-slit2-d-16-antibody.html') 所以,你得核对下你购买的产品货号哦。

此外,关于参照两个不同说明书的建议,我在另一个帖子中也提到过:cuturl('http://biochemistry.dxy.cn/bbs/thread/20689911')

在确定目的蛋白存在的前提下,将膜从50kDa剪到250kDa,再封闭你的抗体,应该不会落下什么啦。

祝好运!
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utt0989[使用道具]
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首先,对于转膜条件,我们实验室,湿转用250mA,80min,80-140KD大小的分子,效果都是很好的,楼主的条件似乎电流太高,时间太长。

另外,santa的抗体楼主的比例是多少呢,我们一般用1:200,santa的抗体经常会不稳定,所以要多摸索几次,而且抗体具体识别的位点还是看说明书上的图片最好,一般Application中的,是总分子大小,但不一定是抗体识别的那一段,所以第一次做还是整张膜都拿去孵育,我曾经就是过说明书上没讲清楚,一直当着80KD做的,后来用整张膜去做,才发现是56KD的。
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我抗体的货号是sc-16619,我提过细胞的RNA做过普通的RT-PCR,基因水平它们是表达的,那是不是代表蛋白水平也应该有表达啊?

另外一定要将膜从50kDa剪到250kDa吗?如此摸转膜条件的话,感觉很浪费抗体诶。
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你觉得我转膜的电流可能过大,时间可能过长,这也是我不解的地方,按照一般的条件,这样子转膜应该可以了,但是我每次转膜后为什么胶考染仍能看到条带,而丽春红染膜的时候却未见条带?这些现象似乎又暗示我转膜还不够充分,是否是我忽略了其他什么关键的问题?

抗体我第一次是1:500稀释的,第二次改为1:200,均未见条带。说明书上未提供任何图片,所以我还是不晓得该抗体结合的片段是多大?查看了说明书上“SELECT PRODUCT CITATIONS”部分提及的三篇参考文献,都未用此抗体做western的
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wanglaoshi[使用道具]
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SANTA抗体一定好使吗,我就吃过亏,真耽误时间呀,如果有经费的话,换ABCAM或CST的吧,基本都能做出来
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Ao7[使用道具]
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你的胶和膜在转前是不是没有泡透,才导致转膜速度较低~
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veiwu[使用道具]
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你确定你的抗体能特异结合你的蛋白55kd末端,或者说55kd处结合条带最明显?
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