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标题:【讨论帖】In cell Western

kuaizige[使用道具]
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【讨论帖】In cell Western


和大家再分享讨论一项技术,In-cell Wstern。

说白一点,In-cell western就是利用不同的抗体,直接将细胞在96孔板上进行蛋白表达的检测,但是检测原理与Western类似(其实和ELISA也差不多吧)。
可参考网页:
cuturl('http://www.cellsignal.com/ddt/licor.html')

优势:
最明显的优势大概就是高通量了,至少一次检测了96个样品的蛋白水平,有利于检测剂量关系;
可以利用不同荧光标记的二抗来双染;
比Western的定量效果要好;
操作比Western简便;
另外,不知能否直接看到细胞内蛋白的分布,类似作免疫组化?(这个是我猜想,还没有实际操作,但是最近会尝试,有结果再来讨论~~~)
。。。。。。。。。。。。。

缺点:
什么试验都会有不足的,这个与Western比较,不能区分出蛋白的分子量了;
而且对抗体的要求会比较高,特异性要好;
。。。。。。。。。。。

大概的操作步骤流程:
1。以一定密度包被细胞于96孔细胞板上培养;
2。生长到合适密度后,加药物或其他处理;
3。一定时间后,用4%多聚甲醛(?)固定;
4。1-3% BSA封闭30 min(如果胞内蛋白,也许需要加入0.1% triton 15 min打孔);
5。合适浓度1抗 1h(如果双染的话,不知是同时加好还是分开加好?)
6。合适浓度2抗 30 min
7。检测

实际操作过一次,单染的,最后用的AP标记的二抗然后显色的,基本上有些结果,有趋势,但不理想。
下面准备换用不同用荧光标记的二抗在一个孔内同时检测目的基因和Actin。

如果有好的结果或者有问题会随时发布在这里,希望有做过的指点!欢迎大家讨论~~~~
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dreaming[使用道具]
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做这个之前,如果用western确定各个抗体能做出很特意的条带来,那么这个办法是再好不过了。如果western不特意,会有假阳性。

用licor的机器去扫描,非常方面和高通量。一次可以做上百个样品。而且用机器自带的软件可以进行signal强度分析。爽。。
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kuaizige[使用道具]
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QUOTE:
原帖由 dreaming 于 2013-11-27 19:50 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')

做这个之前,如果用western确定各个抗体能做出很特意的条带来,那么这个办法是再好不过了。如果western不特意,会有假阳性。

用licor的机器去扫描,非常方面和高通量。一次可以做上百个样品。而且用机器自带的软件可以进行 ...

多谢指点~~~~看来mybbff 版主很有经验,请多多指教哈~~~

Li-COR公司看来是做in-cell western比较权威的公司了,下面这个链接是该公司的一个应用实例说明书
cuturl('www.licor.com/bio/aerius/documents/LICOR_ICW.pdf')
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ROSE李[使用道具]
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我觉得这个方法主要优点是省时省力,适合高通量筛选;
另外想请教一下:
1、二抗是不是只能用荧光标记的;
2、细胞样品没有经过预处理,是不是干扰因素较多,尤其是细胞内蛋白的检测;
3、试验结果是否能够保存;
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bluelake[使用道具]
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1、荧光二抗才可能有不同的颜色来显示。才能有所区分。

2、我还是认为抗体不特异的话容易出现假阳性。

3、试验结果在安装有licor公司软件的电脑里是可以保存和分析的。放到一般的电脑里就跟western的结果一样。
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kuaizige[使用道具]
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3、试验结果在安装有licor公司软件的电脑里是可以保存和分析的。放到一般的电脑里就跟western的结果一样。

===========================================================================================

请教一下这点,如果有能够可监测荧光的96孔板的reader,然后就是按照类似ELISA的方法去读板分析不是也可以吗?
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bluelake[使用道具]
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QUOTE:
原帖由 kuaizige 于 2013-11-27 19:52 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
3、试验结果在安装有licor公司软件的电脑里是可以保存和分析的。放到一般的电脑里就跟western的结果一样。

===========================================================================================

请教一 ...


这个我不敢说。

我们用的是licor的机器,自带的有软件,可以保留结果并继续分析。


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bluelake[使用道具]
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再看一下,其实我也不咋懂。

二把刀而已。


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kuaizige[使用道具]
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LICOR的仪器指的是那个像是扫描仪的吧,我去看了下说明书,好像确实可以读96孔板,呵呵,谢谢mybbff版主~~~

不过从理论上讲,如果没有LICOR的仪器,用可以检测荧光96孔板的reader应该也可以用吧?我准备都试一下,现在正准备细胞,争取下周能有结果~~~~到时放上来大家讨论~~~
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