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标题:【求助】要证明三种蛋白是否连接在一起形成复合物...

xue258[使用道具]
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【求助】要证明三种蛋白是否连接在一起形成复合物...


细胞里的蛋白A、B、C,已有实验证明A和B连接在一起,B和C也连接在一起,A和C有可能通过B的中间作用,形成A/B/C复合物,那该如何证明
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yonger[使用道具]
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cross-linked 然后跑胶分别用三个抗体作WB。
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u234[使用道具]
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老兄 我也有个跟你类似的问题 觉得3个亚基可以结合在一起 但到现在还没想出怎么证明呢
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u234[使用道具]
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我在想能不能跑非变性胶 然后用三个抗体检测
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orangecake[使用道具]
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细胞里的蛋白A、B、C,已有实验证明A和B连接在一起,B和C也连接在一起,A和C有可能通过B的中间作用,形成A/B/C复合物,那该如何证明

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做co-IP?
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am10[使用道具]
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酵母双杂交应该可以验证 A/B B/C 的结合。

如果构建三个质粒,融合的A ,融合的 C,单独的 B。A 和 C其中 一个binding, 一个activating。也许可以检测到。
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abc816[使用道具]
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co-ip是很简捷的方法,可以算初步证明。

two-hybrid是分子生物学上的证明。

Cross-linking是化学证明。cross-linking就是水溶性用缩合剂(EDC)将非共价键结合的复合体用化学键连起来, 在变性胶下不会离解。由于复合体是in close proximity,在低浓度的edc状态下,复合体的亚基间发生化学偶联的机会比游离的蛋白高。偶联后,会产生一个大的不可离解的复合体。当初发现核糖体就是这么发现的。

采用蛋白晶片和抗体晶片也行,原理与co-ip相同。

跑非变性胶,复合体也有可能离解。用gel-filtration (Sephadex,Spephacryl)也行,但样品量要求很大。
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taoshengyijiu[使用道具]
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共沉淀的问题在于只能用A去沉淀检测C或者c去沉淀检测A,其他的因为AB BC均不说明问题,这样最多说明AC可能在一起,还是没有提供ABC在一起的直接证据。

cross-linking我还是没懂,就是说只有蛋白已经结合在一起了,linking上以后结合牢固了,这样可以跑胶用抗体检测了,而本来不在一起的蛋白不会连上,可以这样理解吗?

谢谢高手们的回答!
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qhyu[使用道具]
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cross-linking的理解是对的,但反应浓度和时间很讲究。否则会发生与非complexed蛋白偶联。edc的作用机理是: 先与蛋白的羧基(COOH)脱水形成活性中间体, 然后与氨基反应成稳定的脒键(amide bond)。这个活性中间体能迅速降解, 所以已经形成complex的蛋白被相互连接的可能性大大于与非complex的蛋白。所以控制反应浓度,时间很重要。

共沉淀的理解不对。比如:你用抗A的抗体作IP, IP下来的complex跑胶分别用抗A,抗B,抗C的抗体WB检测, 如果3个抗体都出现信号,那么初步认为是ABC是复合体。如过出现了A,C而无B信号,是A-C复合体,如过出现A,Ber无C信号,是A-B复合体。如果出现B,C无A信号,无效。

你可以用任何一个或A或B或C的抗体作为IP抗体。 只要是Complex, 用哪一个抗体IP,结果一样。问题在于那一个抗体能IP。 complexed蛋白的epitope也许会被覆盖,就IP不成了。
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ritou1985[使用道具]
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共沉淀的理解不对。比如:你用抗A的抗体作IP, IP下来的complex跑胶分别用抗A,抗B,抗C的抗体WB检测, 如果3个抗体都出现信号,那么初步认为是ABC是复合体。

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应该说明可能存在AC,AB,ABC三种复合体吧。如果楼主是要证明A、C是通过B形成复合体,那可能需要缺失突变B吧。
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