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听过制备胶没有?制备胶的意思就是专门为质谱鉴定而准备的,你可以这样操作,图谱分析的时候采用银染,分析完后标记好需要鉴定的差异点,然后你专门做一块考染的凝胶,从考染的凝胶上挖取差异点做鉴定,这样整个问题就解决了!不过银染其实最大的问题倒不是你说的质谱鉴定(现在很多质谱鉴定都采用串联质谱、只要各方面技术比较好的话,鉴定成功率一般在80%左右应该是可以达到的),而是重复性,重复性不好,导致分析困难,所以我自己整个实验用的都是考染!只要上样量得到,电泳程序合适,考染也可以做得跟银染差不多的效果!