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标题:【求助】银染还是考染??

kulee[使用道具]
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【求助】银染还是考染??

请问各位前辈,您们都是做银染还是考染啊?银染的灵敏度高,但是有时候操作不好胶就变成大花脸了,而且听说银染的胶做一级质谱鉴定率只有30%, 考染要求蛋白上样量大,想请问考染比起银染来会丢失一些蛋白点吗?到底采用哪个比较好??请各位前辈指点!!谢谢!!
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yychen[使用道具]
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不知道你的具体要求是怎样的,如果是进行差异比较的话就用银染,这个灵敏度高,可以鉴定出更多的蛋白点,如果要进行后续的质谱鉴定的话就用考染。
其实银染的鉴定率也不见得这么低,鉴定率低的话你可以适当加大上样量,另外还要看你酶解的工作了。酶解好了质谱同样可以检测到更多的蛋白质点的。
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kulee[使用道具]
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QUOTE:
原帖由 yychen 于 2013-12-9 22:15 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')

不知道你的具体要求是怎样的,如果是进行差异比较的话就用银染,这个灵敏度高,可以鉴定出更多的蛋白点,如果要进行后续的质谱鉴定的话就用考染。
其实银染的鉴定率也不见得这么低,鉴定率低的话你可以适当加大上样量,另外还要 ...

谢谢前辈,我以后要做质谱,这两次做银染背景老花花的,都快疯了。。。。。
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听过制备胶没有?制备胶的意思就是专门为质谱鉴定而准备的,你可以这样操作,图谱分析的时候采用银染,分析完后标记好需要鉴定的差异点,然后你专门做一块考染的凝胶,从考染的凝胶上挖取差异点做鉴定,这样整个问题就解决了!不过银染其实最大的问题倒不是你说的质谱鉴定(现在很多质谱鉴定都采用串联质谱、只要各方面技术比较好的话,鉴定成功率一般在80%左右应该是可以达到的),而是重复性,重复性不好,导致分析困难,所以我自己整个实验用的都是考染!只要上样量得到,电泳程序合适,考染也可以做得跟银染差不多的效果!
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kulee[使用道具]
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QUOTE:
原帖由 gogo 于 2013-12-9 22:17 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')

听过制备胶没有?制备胶的意思就是专门为质谱鉴定而准备的,你可以这样操作,图谱分析的时候采用银染,分析完后标记好需要鉴定的差异点,然后你专门做一块考染的凝胶,从考染的凝胶上挖取差异点做鉴定,这样整个问题就解决了!不过 ...

谢谢前辈指导,您说的用银染分析,用考染质谱,但是有的点出现在银染的胶上 ,但是在考染上面找不到,这个问题咋办呢》?前辈能不能透露下您考染的方法,按照分子克隆上可以吗?
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jujuba[使用道具]
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如果考染能染出来,就不要用银染,现在点数高的文章不太认银染的结果。
考染染不出来,实在不行才考虑换银染。做质谱鉴定的时候,银染胶不要加戊二醛,成功率会高很多,当然要找质谱水平高些的人来做。
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HP007[使用道具]
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效果确实很不错,可以达到和银染差不多的效果,如果考染上找不到,那就只有从银染图谱上挖点了。至于质谱,确实如“好小猫”所说一方面不要加戊二醛,一方面找技术好的人,我的一个做了很多年质谱的朋友告诉我,一般银染成功率可以达到80%,考染可以达到95%。
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子衿青青[使用道具]
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做银染胶内酶解需要注意些什么啊
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