表观遗传学

请教一些DNA甲基化的技术问题。比如说我要在群体中验证几个基因promoter是否甲基化的问题，有哪些比较好的技术。
比较着急，在线等，Thanks very much！

焦磷酸测序，，高容量曲线分析，MSP等。

DNA甲基化的研究主要着眼于研究CpG岛尤其是基因启动子区域DNA甲基化水平的改变。为了全面检测样品基因组DNA的甲基化模式，高通量的芯片检测成为首选。康成生物研发团队率先引入先进的MeDIP技术，实现了甲基化DNA的高效富集，并将该技术与Agilent公司及 NimbleGen公司的甲基化芯片完美结合，实现生物样品的甲基化模式的高通量分析。

芯片的实验结果有必要进行进一步的验证。康成生物为特定甲基化DNA区域的验证提供了四种方案供研究人员选择：甲基化DNA免疫共沉淀—实时荧光定量PCR（MeDIP—qPCR），结合重亚硫酸眼的限制性内切酶法（COBRA），甲基化特异性的PCR（MSP），结合重亚硫酸盐的测序法（Bisulfite Genomic Sequence）。

DNA甲基化的研究主要着眼于研究CpG岛尤其是基因启动子区域DNA甲基化水平的改变。为了全面检测样品基因组DNA的甲基化模式，高通量的芯片检测成为首选。康成生物研发团队率先引入先进的MeDIP技术，实现了甲基化DNA的高效富集，并将该技术与Agilent公司及 NimbleGen公司的甲基化芯片完美结合，实现生物样品的甲基化模式的高通量分析。

芯片的实验结果有必要进行进一步的验证。康成生物为特定甲基化DNA区域的验证提供了四种方案供研究人员选择：甲基化DNA免疫共沉淀—实时荧光定量PCR（MeDIP—qPCR），结合重亚硫酸眼的限制性内切酶法（COBRA），甲基化特异性的PCR（MSP），结合重亚硫酸盐的测序法（Bisulfite Genomic Sequence）。

把这些基因的启动子BSP，然后根据样本混在一起，通过加454的BARCODE上机测序，最后根据BARCODE区分各样本，比对回这几个基因的启动子区，然后就是统每个CPG位点的C和T的比例。

测序要三思，不能什么都测序，又贵又麻烦，还不一定能得到你要的结果，除非有做大规模实验的打算或是在没clue除外，，，对于这种要验证特定基因启动子甲基化状态的同学，强烈建议使用MSP(Methylation-Specific PCR), 这根本就是MSP最典型的应用啦，先用亚硫酸盐DNA甲基化处理试剂盒，把非甲基化的C转化成U，围绕可能的位点设计引物，直接就可以检测出来，特异性很高很灵敏的，，这个实验关键有两步，DNA转化和引物设计，，前者推荐用Millipore 的 CpGenome Turbo,,用过很好用，也是市面最快了，其他的动辄数小时到十几小时，DNA都被处理坏了，这个只要90min