表观遗传学

菜鸟求助各位高手，我以前没怎么涉及到基因，遗传这块研究的，我们老板想研究功能性肠病相关的表观遗传机制，我查了下几乎研究的都是肿瘤方面的，我找不到现成的目标基因进行研究，该如何着手进行呢，取肠道粘膜的组织做基因表达谱分析，找出表达差异的基因进行甲基化研究分析吗?那个是不是很费钱,可行吗？有没有什么好点的方法，能否指点一二，让我有个方向，不胜感激。

在你不知道目标基因的情况下，从表达谱入手不失为一个办法，但是引起基因表达差异不一定是基因启动子区甲基化异常造成的，我觉得这个课题有点探索性质,也许我不了解功能性肠病的发病机理，我只是从我的课题说起，我也是没有目标基因可选，所以先做表达谱，找差异，然后看甲基化差异，可惜我没有发现与表达谱对应的甲基化差异。

这个东西我做过，表达谱还有甲基化都做过，不过肯定是先要做表达谱分析找出差异，然后差集基因可以聚类分析，找到和癌病相关的哪一类，然后做个代谢图分析，看看调控那些通路，这样就差不多了，针对关键的通路上的基因再去分析就好，后面还有很深的研究呢，你老板有多少经费啊，这个课题很大的。