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标题:【求助】DNA 甲基化为什么能抑制基因表达

ssonglikihi[使用道具]
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发表于 2013-12-20 20:47 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

【求助】DNA 甲基化为什么能抑制基因表达

都知道DNA甲基化能抑制基因表达，但是为什么？
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市井小民[使用道具]
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发表于 2013-12-20 20:48 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
DNA甲基化能引起染色质结构、DNA构象、DNA稳定性及DNA与蛋白质相互作用方式的改变，从而控制基因表达。



比如：甲基化会促使异染色质化，DNA构象改变（如Z型-B型之间的转变）。更深一层的机理应该是甲基的引入使得分子内或分子间的非共价键重新分配等，这样也会影响DNA与转录因子的结合等等。
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市井小民[使用道具]
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发表于 2013-12-20 20:48 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
结构基因含有很多CpG 结构, 2CpG 和2GPC 中两个胞嘧啶的5 位碳原子通常被甲基化, 且两个甲基集团在DNA 双链大沟中呈特定三维结构。基因组中60%～ 90% 的CpG 都被甲基化, 未甲基化的CpG 成簇地组成CpG 岛, 位于结构基因启动子的核心序列和转录起始点。有实验证明超甲基化阻遏转录的进行。DNA 甲基化可引起基因组中相应区域染色质结构变化, 使DNA 失去核酶ö限制性内切酶的切割位点, 以及DNA 酶的敏感位点, 使染色质高度螺旋化, 凝缩成团, 失去转录活性。
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changlhsyo[使用道具]
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发表于 2013-12-20 20:49 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
补充几点:



1,蛋白特异结合DNA的化学基础是DNA结合蛋白能够识别DNA双螺旋大沟中的氢键信息.5mC的甲基正好位于大沟中.因此,它的存在可能会干扰转录因子对碱基序列的识别,从而抑制基因表达.



2.细胞中存在甲基结合蛋白MBD.当CG岛中的C被甲基化后,能够与MBD结合,同时MBD招募来组蛋白去乙酰化酶,使得组蛋白去乙酰化,从而导致异染色质化,阻碍转录因子及RNA聚合酶与DNA的结合.



3.更多细节,请多看文献.学无止境!

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ssonglikihi[使用道具]
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发表于 2013-12-20 20:49 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
恩，很详细了！！！！！！！！
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发表于 2013-12-20 20:50 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
在我的了解中HDAC不是这样发挥作用的

它是抑制DNMT1表达的
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ssonglikihi[使用道具]
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发表于 2013-12-20 20:51 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
刚才没把图贴上
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changlhsyo[使用道具]
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发表于 2013-12-20 20:51 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
HDAC对基因表达的抑制是广谱性的，在某些情况下，它当然也能抑制DNMT1的表达。所以你说的HDAC抑制DNMT1表达只是HDAC抑制基因表达的一个特例。HDAC即组蛋白去乙酰化酶，我们知道组蛋白的乙酰化能使染色体结构松散，从而促进基因表达，因此去乙酰化就能起到相反作用，即抑制基因表达。甲基化位点能募集MBD，而MBD募集HDAC,这是甲基化抑制基因表达的一个策略。



在你提供的模型中,HDAC可能是做为绝缘子,而非去乙酰化来抑制表达,但毕竟只是一个特例而已.
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ssonglikihi[使用道具]
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发表于 2013-12-20 20:51 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
我的意思中从你的模型中可以看出甲基化抑制基因表达是通过HDAC起作用的，而我提供的模型却显示dnmt1表达受到HDAC的抑制，从而减少甲基化，这两个是否有矛盾呢？
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changlhsyo[使用道具]
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发表于 2013-12-20 20:52 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
当然不会有矛盾. 你需要看清楚的是,你所提供的模型,HDAC的抑制作用是细胞周期依赖性的.DNMT1的作用是完成DNA复制后的半甲基化,它的作用主要发生在S期.因此,DNMT1需要在late G1期及S期表达. 但是,在漫长的G0/G1期,DNMT1是没有作用的,所以它的表达需要被抑制.
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