【求助】如何进行缺陷基因定位？

最新回复

• 人小鬼大 (2013-12-20 21:10:34)

  有老鼠的家系吗
  
  没有很难做，要用大规模关联分析
  
  用老鼠全基因组芯片

• luoliqiong (2013-12-20 21:10:42)

  我已将其培育为近交系，这样的话下一步应该怎么做呢？请指教！
  
  连锁分析？还是基因芯片？

• 人小鬼大 (2013-12-20 21:10:53)

  都可以
  
  连锁分析也可以用芯片

• luoliqiong (2013-12-20 21:11:07)

  还是一头雾水，能不能再解释多一点？
  
  目前，基因芯片哪里可以做呢？

• luoliqiong (2013-12-20 21:11:35)

  再请教：基因芯片技术是否成熟可靠？目前国内哪些公司做的好呢？

• 12xunmei (2013-12-20 21:12:11)

  现在芯片是非常成熟的。不过好像老鼠的snp芯片没。

• 人小鬼大 (2013-12-20 21:12:25)

  怎么没有
  
  illumina affy 罗氏都有大鼠的
  
  snp芯片
  
  illumina也可以根据老鼠基因组定制

• 人小鬼大 (2013-12-20 21:13:02)

  首先要构建患者和非患者的群体，一般不小于200个（若为但基因控制的性状），进行对比研究、基因组扫描，首先进行定位，然后可以进行精细定位，或图位克隆。

• 人小鬼大 (2013-12-20 21:13:55)

  刚才说的是人类，
  
  老鼠的用动物的qtl就可以

• luoliqiong (2013-12-20 21:14:10)

  询问了基因芯片公司，说现在大鼠的snp芯片还没有。有哪位老大知道什么公司有大鼠的snp芯片吗？根据基因组定制芯片价格怎么样呢？

• 12xunmei (2013-12-20 21:14:30)

  可以先将该“缺陷”大鼠与野生型杂交，后代F1应该都为杂合子携带者
  
  然后用F1代自交，预期会产生1/4数目的F2与亲代“缺陷”大鼠有类似表型
  
  由于大鼠繁殖能力强，故而容易产生大量F2个体
  
  如此两代（F1+F2)大鼠家系很容易通过STR全基因组扫描来对疾病位点进行定位
  
  如果F1代个体中发现有与亲代表型类似的大鼠个体
  
  则表明很可能在大鼠中该性状可能是显性
  
  此时产生大量F1代个体做家系STR全基因组扫描即可

• luoliqiong (2013-12-20 21:14:40)

  已经证明该缺陷为单基因常染色体隐性遗传，因此，可用F2个体进行基因定位。目前的问题是应首先确定缺陷大鼠与野生型（或其他）大鼠之间的差异遗传标记，str或snp均可，有没有什么高通量、快速的的方法来确定这种差异呢？