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说说你的实验的目的?
做蛋白的confocal,还真是没有做过,
不过估计你是想看类似结构的信息,比如是几聚体之类的,
不过confocal一般的步长比较大,而且分辨率不够,大概在200-300nm左右,基本是极限,最好的能到15nm,不过貌似国内还没有这样的仪器(但是原理已经改变,也有可能是纤维storm,一次出三维结构,不过这个东西的商业化好像还没有这么快,这是哈弗的一个光学实验室的技术)。但是也不足以做你要的信息,对于单个的蛋白质,比如球蛋白,BSA大概是5nm左右,你可以估算一下你的蛋白的大概尺度。光学confocal肯定不够,电子的没见过,可能是孤陋寡闻
我估计你可能是用电子显微镜,然后做单颗粒的构象重构,能够得到一些类似结构信息。
或者你的颗粒比较大,可以试着做一些DLS(动态光散射),看看大致的大小,然后跑SDS-PAGE加native-page来看看你蛋白是几个聚合在一起的等等。这些要比单颗粒的重构简单,快速。
不过做实验前先描述好你的实验目的,否则你的实验选择是很盲目的。
如果你真找到了电子显微镜的confocal,记得把链接发出来,我也想看看这个东西