表观遗传学

最近在筛好几个家系，对其中的一个可能的致病基因进行测序后发现，所有家系内的所有患者都可以筛到相同的同义突变一到两个，碱基由C-T,仔细观察，我发现了很多患者都有一个相同的同意突变。

请问：

1.如何让验证此同义突变的意义。

2. 或者本身这个突变就没有任何意义。

3. 如果要确认这个同义突变的话，有没有什么相对成熟的技术路线或方法进行验证。

4. 如何预测这个同义突变翻译的氨基酸的功能。

5. 如果扩大在患者的正常家属以及其他人群中扫描，如果未见这类同义突变，那么这些同义突变是不是可以作为一个筛查的指标呢?

6.除了上述的这种扩大样本扫描来排除的办法，还有其他高招吗？

7.抑或本身这个想法就是错误的，其他的高招。

个人知道问题很多，但是个人觉得有继续研究下去的价值，所以请各位大大不惜赐教，万分感谢！

1、2，能否问得更清楚一点？验证同义突变的意义？同义突变对于解释你这个疾病应该起不到作用。

3，5，要作为一个指标还差两个步骤——1，在家系内的正常人都不携带这个突变，2，在其他散发病例中也能测到这个突变，至少一个。

4，预测突变的功能有软件的——GO，KEGG

6，家系内的正常人是否有这个突变，没有更好，有的话你这个结论缺乏证据。

同意的变化不是说一定不能影响蛋白功能，但这种例子真的挺少的



我发现你好像根本没有测家系里的正常人？这个实在是最起码的工作。另外还要查这个同意变化在人群多态数据库，如dbSNP， ESP6500 里的频率

首先感谢楼上两位的热心，最近一直在纠结这个问题

由于我所检测的这个疾病我已经把所有已经报道过的可能相关的基因全部扫描了一遍，包括家系内正常人，没有特殊发现，但是只有这几个同意突变在患者的测序报告中反复出现，且频率极高，因此，我才将这些同义突变作为筛选靶标。由于前段时间一直是在将这些同义突变通过计算机及部分生物学软件来预测其可能的功能，发现了这些同义突变的确会影响到其表达的蛋白功能，因此才会沉默了一段时间。

可悲的是老板居然不理解，呵呵。

最近在设计实验来验证我的想法

1.可以查基因突变数据库，看此突变是否为致病突变，但是即使数据库没有记录，其实也是不能排除其致病的可能性。

2.查SNP数据库，看此突变是否为一个多态，即使该突变为多态，如果基因型与表型共分离，此位点突变也有可能跟某未知的致病突变连锁。

有什么好呵呵的。你到底查了这几个同义突变在人群中的频率吗

请问哪个数据库可以做到同义突变在人群的频率？

不胜感谢

现有的数据库都是针对不同研究和手段筛查到的所有变异进行归纳总结，没有特异是针对某种类型的变异，倒是1000Genome有对变异的类型进行分类。建议你可以去看下？

同义突变会影响到蛋白的功能么？不能吧，编码的氨基酸不改变的话怎么会改变蛋白的功能呢？求解。

我觉得楼主可以试着去探讨相关的基因功能，不要把思路老是停留在这个同义突变本身，像上面有的战友说的这个突变可能会影响别的基因的功能，从而与该疾病相关呢？

谢谢各位的回答。我已经让这个患者去做进一步的基因分析。