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标题:【求助】蛋白变性纯化后的复性

superboy[使用道具]
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1
 

【求助】蛋白变性纯化后的复性


情况如下:
基因工程发酵纯化一种38肽(cP),载体为pet32a,宿主菌为大肠杆菌BL21,目的蛋白为硫氧环蛋白-cP融合蛋白;测序证明碱基序列正确,小量发酵验证融合蛋白大小正确;问题及解决方法如下:
1.超声破菌,400W、3s/3s、40min,证明目的融合蛋白在破菌上清,但蛋白条带由1条变成了3 条,超声条件为80W、3s/3s、10min,菌悬液非常浑浊,电泳后依然为3条带,故认为蛋白被降解;
2.菌悬液用溶菌酶重悬后37℃水浴30min,取样电泳,蛋白条带有3条,即蛋白被降解;
注:1、2菌悬液中均加了1mM的PMSF、5mMEDTA、2mMβ巯基乙醇。
3.综上,决定采用变性纯化法,即先用含8M尿素的缓冲液充分重悬菌体,超声破菌,去上清及沉淀电泳,融合蛋白在破菌上清,1条带;
4.上清挂柱,6M-1M尿素复性缓冲液梯度洗柱,使蛋白复性,再用咪唑洗脱;
5.将含融合蛋白的洗脱液超滤,第一次加水即出现白色絮状沉淀;超滤不可行;
6.将含融合蛋白的洗脱液透析,1h内透析袋内液体浑浊,后液体逐渐澄清,但透析袋底部出现团块沉淀;
7.将透析袋内液体超滤;
8.电泳,样品有咪唑洗脱液、透析后超滤得溶液、透析后超滤滤出液、透析中形成的沉淀,发现透析后所得的液体基本上不含融合蛋白,沉淀是融合蛋白,但是沉淀凝聚成团,超声都打不碎,8M尿素也溶解不了;
9.取沉淀直接用蛋白酶酶切,取酶切溶液及剩余沉淀电泳,发现只有一少部分被切开而可溶,大部分仍然以沉淀形式存在。
亲爱滴们,我现在做纯化都半年了,急着拿到蛋白做活性呢,有没有什么高招传授传授?
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2
 
superboy的问题说得比较明白,致敬!
有几个疑点:
1、表达量如何?
2、超声过程中注意冰水浴了吗?
3、“蛋白条带由1条变成3条”是不是说表达后的全菌电泳目标蛋白是一条带,而在超声或溶菌酶处理后这1条带降解成了3条?
4、降解成的3条带中还有原来的融合蛋白条带吗,量如何?
5、变性纯化后的纯度如何?
6、能否把相关电泳图发上来看看?
我的原则,如果是上清可溶表达,要想拿到活性蛋白无论如何都不要采用变性方法或在破菌缓冲液中加还原剂。
如果你那降解的3条带中还有融合蛋白的话,不妨就用它纯化试试看。
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3
 


QUOTE:
原帖由 superboy 于 2014-1-6 16:35 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')

情况如下:
基因工程发酵纯化一种38肽(cP),载体为pet32a,宿主菌为大肠杆菌BL21,目的蛋白为硫氧环蛋白-cP融合蛋白;测序证明碱基序列正确,小量发酵验证融合蛋白大小正确;问题及解决方法如下:
1.超声破菌,400W、3s/3s、40min,证明目 ...

1.目的蛋白稳定性有问题(1、2、3条分析),
2.你这蛋白水溶性有问题啊(从5、6、7、8条分析),
3.会否考虑换个融合蛋白(考虑解决溶解性及稳定性的问题)或者链接的那1小段。
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感觉有几个疑问:
1 这个38 肽是否具有稳定的高级结构? 有没有必要变性复性?
2 宿主菌为大肠杆菌BL21 ? 确定不是 BL21(DE3) ?这两个宿主细菌对 pET32 质粒来说,有天壤之别。
3 挂柱复性看来没有成功。1M尿素仍然使融合蛋白质保持变性状态。
4 电泳三条带能不能就确认为蛋白质降解? western 过吗?
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5
 
都忘了这里的求助了。
先回答skykiller的问题:蛋白表达量不高,但也不低;
超声过程一直是在冰上进行的;
全菌电泳目的蛋白是一条带;
降解成3条带后,大部分情况下是有目的融合蛋白的,量比较少;
变性纯化后纯度还是挺不错的,附图。
再回答楼上的问题:蛋白应该没有高级结构,我使用变性复性主要是因为一般条件破
菌蛋白会降解;
宿主菌是BL21(DE3),我们实验室常用的菌种;
复性成不成功我不知道怎么检测,1M尿素洗完我还用0M尿素洗了
好多体积呢;
没有做过western,但我认为应该是讲解了,因为变性纯化时时1
条带,正常纯化就是3条带,不是降解的话不太好说明吧?


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superboy[使用道具]
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上幅是变形纯化后的胶图;这里是正常破菌纯化的胶图。


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请问有没有试过不带任何标签直接表达?
或者仅带含Thrombin 位点的 His-Tag 标签表达?
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NBA[使用道具]
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两个建议:
1、用非变性纯化样品去做EK酶切、纯化。
如果融合蛋白的降解是从N端开始的,而C端没有降解,那么应该能够拿到38肽。
我曾经有个这么个类似情况,酶切后证实是N端降解,C端的目的蛋白好好的,大小都对。
做EK酶切多了,往往会发现,PET32a的融合段硫氧还蛋白加histag部分确实易被进一步酶切水解。但Ni柱的结合特性不变,说明水解是从N端开始的。
先做酶切梯度,电泳确定酶量标准。不要用酶说明书的量,有时候差距非常大。和蛋白种类相关。
酶切后的纯化方法首选Ni柱穿透纯化,可能要加少许咪唑及盐,以利用酶切后的目标蛋白不吸附Ni柱。
2、用变性纯化的样品做复性处理
变性纯化的样品纯度不错,查阅一下有关的复性方法资料,设计一个方案。
你用超滤和透析的方法都失败了,可以考虑用稀释的方法,控制终蛋白浓度小于0.1mg/ml,蠕动泵滴入搅拌的稀释液中,pH控制高的,如pH9-10,适当加一些甘油和EDTA,DTT。
做过复性后再走酶切的路线。
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既然变性纯化行不通,那就复性呗,复性后纯化就好做了。
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superboy[使用道具]
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谢谢各位,使我茅塞顿开啊,我试试先。
但是现在又碰到一个问题啊,我拿正常破菌后纯化的蛋白去超滤,结果都沉淀了,是为何呢?
有没有比较好的方法既能除盐又能浓缩啊,(⊙_⊙),我们实验室条件比较差,别太难的方法,再次谢谢各位~\(≧▽≦)/~啦啦啦!
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