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标题:【求助】2-D求助,大家帮我分析一下原因吧!

veiwu[使用道具]
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【求助】2-D求助,大家帮我分析一下原因吧!


我最近在做燕窝双向电泳,图谱放在word里面了,丙酮沉淀、TCA-丙酮沉淀还有酚抽提的方法都试验过了,2-D图谱还是没有改善,酸端大量横竖条纹,蛋白质点少,等电聚焦电压上不去,估计是盐分太多或者是糖蛋白,大家帮我提一些意见,先谢谢了!
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超声破碎(去离子水),丙酮沉淀,丙酮洗涤,冷冻干燥,裂解液(8M尿素,4%CHAPS,100Mm DTT, 0.5% CA),上样蛋白:850ug,等电聚焦电压达到3100V,总为11000Vh
pH3-5.6胶条,7cm,银染
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veiwu[使用道具]
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蛋白沉淀方法的比较:
样品1:丙酮沉淀,丙酮洗涤
样品2:TCA-丙酮沉淀,丙酮洗涤
样品3:酚抽提,甲醇、丙酮洗涤
样品4:TCA-丙酮沉淀蛋白干粉,溶解后酚抽提,甲醇、丙酮洗涤
样品5:丙酮沉淀干粉裂解液溶解后,超滤浓缩管除盐
样品6:TCA-丙酮沉淀干粉裂解液溶解后,超滤浓缩管除盐
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veiwu[使用道具]
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离心管超滤除盐,GE公司clean-up试剂盒也用了,等电聚焦的时候设置的电压还是上不去,特别是clean-up试剂盒纯化样品后蛋白浓度降低了好多,大概有接近10倍。现在是一筹莫展!
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裂解液中没有硫脲,会不会有影响呢?(硫脲的作用是辅助尿素的溶解)
比较奇怪的就是用了clean-up试剂,聚焦还是上不去,难道是一向电泳仪有问题??
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电泳仪应该没有问题的,因为其他同学也在跑双向,一切正常。酚抽提蛋白后裂解液中含有2M 硫脲,忘记改过来了。
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veiwu[使用道具]
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我想知道酸端黑乎乎那些东西是盐分、糖蛋白还是其它?着急!
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remenb[使用道具]
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850微克,可以考染了。而且是7cm的胶条。胶条越短上样量应该越少的。
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veiwu[使用道具]
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后面上样量都降到20ug了,还是有那么多黑乎乎的东西!
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KGZ564[使用道具]
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蛋白点少会不会是蛋白定量不准确,上样量低的原因呀?
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