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标题:【求助】Western Blot 小妹求高人指点!

ilovegaga[使用道具]
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【求助】Western Blot 小妹求高人指点!


做Western Blot从准备试剂到开始做已经将近一个月了,开始是MARKER和GAPDH死活出不来,更不用说目的蛋白了,连影子也没看见过。
从新购买了试剂:内参Anti-beta Actin 康成(KC-5A08)
一抗水通道蛋白4 博士德(BA1560)
二抗抗兔辣根标记 博士德(BA1054)
ECL试剂盒 康成 (KC-426)
marker 康为(SW0021)
10%的分离胶,5%的浓缩胶。开始是胶不太好凝,分离胶用水封之后大概半个小时就可以凝,但是浓缩胶在梳子的位置就是凝的非常不好!加大了AP和TEMED的量之后,还算好凝,但是也不是很好,希望给些意见!?
现在说关键问题,先上一张图,是我17号做的
上样量是样品孔是每孔样品含量为20ug,加上样缓冲液加水后终体积为20ul,marker是5ul。
电泳浓缩胶80V,分离胶120V,跑了大概1个半小时。
转模,用的我们实验室的一套进口设备,应该是半干转膜,1个半小时。最后实验显影结束之后用考马斯亮蓝染膜和胶,可以说明转膜的时间比较合适,转膜比较完全。
4度封闭过夜,封闭液是5%的奶粉,用TBST配的,奶粉是买的雀巢的脱脂奶粉。
一抗1:200 室温摇床1.5h 封闭液稀释
二抗1:5000 室温摇床1.5h 一抗用封闭液和TBST1:1稀释
内参1:10000 室温摇床1.5h 一抗用封闭液和TBST1:1稀释
结果就是第一张图,MARKER有两个条带成黑影,内参可以看到,但是不清楚,而且,5个样品,只有三个勉强能看到内参的条带。目的蛋白是一点都没有条带!请问原因!?
第二张图的条件是上样量是样品孔是每孔样品含量为50ug,加上样缓冲液加水后终体积为20ul,marker是3ul。
电泳浓缩胶80V,分离胶120V,跑了大概1个半小时。
转模,用的我们实验室的一套进口设备,应该是半干转膜,1个半小时。最后实验显影结束之后用考马斯亮蓝染膜和胶,可以说明转膜的时间比较合适,转膜比较完全。
4度封闭过夜,封闭液是5%的奶粉,用TBST配的,奶粉是买的雀巢的脱脂奶粉。
一抗1:300 室温摇床1.5h 封闭液稀释
二抗1:6000 室温摇床1.5h 一抗用封闭液和TBST1:1稀释
内参1:10000 室温摇床1.5h 一抗用封闭液和TBST1:1稀释
结果MARKER可以看出来了,条带都比较的清晰,可是,内参依然是5个样品只能看到三个,而且是勉强看到,不是很清楚。目的蛋白的条带依然是没有,所以,请教各位大侠帮我解决一下!谢谢!
由于不知道怎么发第二张图,所以,第二张图我用回复发。请各位看!


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第二张图


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看过这两张图后我有几个问题和建议如下:
(1)两次内参出来的条带是否是同样的蛋白样品,如果是,可能说明你的蛋白样品有问题。
(2)电泳的时间有点不够啊,按照你做的胶浓度和电压而言,一般分离胶要1h左右,浓缩胶要2-3小时。
(3)到底是半干转还是湿转,你自己不能区分吗?这两者的条件不一样的,此外你的一抗孵育时间是多少呢?
(4)所配试剂的PH值是否注意到了,你可以再搜集相关方面的材料。
(5)抗体稀释的倍数按照说明书从中间浓度值选择,不要开始就用最大浓度的。
祝你好运!
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1、搂主能否确认样品浓度测量准确?感觉上样量有点少,尽管看到有的文献看到western blot的上样量有30ug的,但还是喜欢用60-80ug。
2、感觉一抗孵育的时间有点短,刚开始摸索实验条件时一般喜欢过夜,甚至是室温过夜。有非特异性条带没有关系,先看到目的条带再说。
3、配胶的试剂是否有问题?ap时间久了?丙稀酰胺是否时间久了?特别是配好的溶液,时间不能太久。
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看过这两张图后我有几个问题和建议如下:
(1)两次内参出来的条带是否是同样的蛋白样品,如果是,可能说明你的蛋白样品有问题。
(2)电泳的时间有点不够啊,按照你做的胶浓度和电压而言,一般分离胶要1h左右,浓缩胶要2-3小时。
(3)到底是半干转还是湿转,你自己不能区分吗?这两者的条件不一样的,此外你的一抗孵育时间是多少呢?
(4)所配试剂的PH值是否注意到了,你可以再搜集相关方面的材料。
(5)抗体稀释的倍数按照说明书从中间浓度值选择,不要开始就用最大浓度的。
祝你好运!

===========================================================================================================

首先谢谢您的提问,可是,13问题都是我上面叙述的很详细的,您完全可以再我的叙述中找到答案。PH值我们都调整过了,完全是严格按照要求的!没有问题。抗体稀释倍数也是从中间开始试的。谢谢
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ilovegaga[使用道具]
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1、搂主能否确认样品浓度测量准确?感觉上样量有点少,尽管看到有的文献看到western blot的上样量有30ug的,但还是喜欢用60-80ug。
2、感觉一抗孵育的时间有点短,刚开始摸索实验条件时一般喜欢过夜,甚至是室温过夜。有非特异性条带没有关系,先看到目的条带再说。
3、配胶的试剂是否有问题?ap时间久了?丙稀酰胺是否时间久了?特别是配好的溶液,时间不能太久。

===============================================

谢谢您,我这次调整了一下上样量,50ug
另外,一抗也换成过夜了,就是还没有出来结果。
AP每次都是先用现配的,丙烯酰胺时间还好吧,2个星期左右。
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ECL显色试剂盒怎么样?
我用DAB显色的方法做过康成的beta-actin一抗,很好的。是不是换一换显色的试剂?
另外,是在找不出原因,可以让同学做一次,因为可能有些细节可能你注意不到,每次做或者是纪录总是不注意的,这个方法是我们的最后一招 :)
好运。
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建议改进实验条件:
1 加大上样量。上样量与加样孔的底面积有关,上样的蛋白量上限为30ug/mm2载荷面(见“抗体技术实验指南”P169)。如果凝胶板为6cm*8cm,梳子为10个泳道,则每个泳道的底面积为5mm2,可加入的最大蛋白量理论上为150ug。加样量偏少,低丰度的蛋白就很难做出来。
2 既然看不到目的条带,就要减少封闭时间,建议封闭1h。封闭过夜只会适得其反。
3 一抗孵育时间可以延长甚至过夜,这点楼上也说过。
4 二抗浓度1:5000-6000低了点,可以提高到1:2000-3000。
总之Western Blot的影响因素很多,需要仔细优化每一步条件。从你描述的情况暂时先提这几点建议,希望对你有所帮助,祝你好运!
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胶跑的不是很好,是否在低温环境中电泳?
对于新手建议使用商品化的western试剂盒,减少摸索条件的时间。
cuturl('http://www.haigene.cn/rapid_western_kit.html')


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建议改进实验条件:
1 加大上样量。上样量与加样孔的底面积有关,上样的蛋白量上限为30ug/mm2载荷面(见“抗体技术实验指南”P169)。如果凝胶板为6cm*8cm,梳子为10个泳道,则每个泳道的底面积为5mm2,可加入的最大蛋白量理论上为150ug。加样量偏少,低丰度的蛋白就很难做出来。
2 既然看不到目的条带,就要减少封闭时间,建议封闭1h。封闭过夜只会适得其反。
3 一抗孵育时间可以延长甚至过夜,这点楼上也说过。
4 二抗浓度1:5000-6000低了点,可以提高到1:2000-3000。
总之Western Blot的影响因素很多,需要仔细优化每一步条件。从你描述的情况暂时先提这几点建议,希望对你有所帮助,祝你好运!

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诚心的感谢您的宝贵意见,我下次做的时候再试一次。谢谢您。

[ 本帖最后由 yes4 于 2014-1-14 17:26 编辑 ]
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