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标题:【求助】大鼠脑组织膜蛋白提取裂解液配方及方法

bohe221[使用道具]
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【求助】大鼠脑组织膜蛋白提取裂解液配方及方法


目的蛋白分子量200左右,是膜蛋白,在院子里搜索过,有几个不同的裂解液配方,想要做western不知道应该用哪个?
还有,听说得用超速离心机,在百度查到20000rpm以上才叫超速,但是我看到院子里有人说只离心一万多,我以前提取细胞蛋白的时候就用了1万4的速度,那时目的蛋白40~50,难道膜蛋白提取跟一般的蛋白提取速度没什么两样吗?
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feima+[使用道具]
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以下是我原来在园子搜到的用来提大鼠脑组织细胞膜蛋白方法:
转发:
取两只大鼠的整个脑组织,加入10ml Buffer A 于冰上充分匀浆。J6-HC离心机800rpm,4℃离心10min后,所得上清液转入超速离心管。100, 000g,4℃离心1hr。弃去上清,沉淀用适量的 Buffer B重悬,冰上孵育2hr后分装至EP管, Eppendorf台式离心机10000rpm,4℃离心30min。所得上清液即为膜组份。
Buffer A:0.32M 蔗糖,5mM Tris-HCl(PH 7.5),120mM KCl,1mM EDTA, 0.2mM PMSF, 1ug/ml Leupeptin, 1ug/ml Pepstatin A, 1ug/ml 。冰上预冷。
Buffer B:20mM HEPES(PH 7.5),10%甘油,2% Triton X-100, 1mM EDTA, 0.2mM PMSF, 1ug/ml Leupeptin, 1ug/ml Pepstatin A, 1ug/ml Aprotinin。 冰上预冷
出处: DXY cuturl('http://www.dxy.cn/bbs/actions/archive/post/165892_0.html')
所以所谓超速并不是 一万多g, 要达到 10万 g 以上 (不要用rpm来恒量离心速度, 除非指明离心机型号). 这个方法我试过, 提到了蛋白, 但我的目标蛋白因为没有检测到, 原因不明, 丰度呀什么的都有可能. 所以还不知道这个方法是否可行. 最好再查些文献来确定.
顺便问问, 一般细胞裂解提取蛋白的方法都要裂解后在 1万g左右离心30到45分取上清, 是什么目的, 要去除什么? 是未裂解的细胞? 是细胞碎片? 是膜碎片? 细胞内亚结构? 真是有些费解.
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bohe221[使用道具]
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谢谢!!
为了保险我还是决定用试剂盒了,就是贵了点,好像PIERCE的产品不错,89826。
细胞裂解后的残渣可能你提到的那些都包括,去除的原因我想就是为了使样品均匀好定量。
上面的那个方法如果你做成功了希望请你继续反馈,呵呵,如果可行的话为了考虑经济问题,我也想换。
我以后的结果也会继续贴上的,其实我要做的是NMDA受体,它是膜蛋白,但是我不是非常清楚它是不是也存在于细胞内,如果它单纯的只存在于膜上,我是不是不用这么费劲的只分离细胞膜呢?如果它在细胞内也有,那么即使条带出来了我也不知道提取膜蛋白有没有成功…………这是个问题…………
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feima+[使用道具]
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NMDA受体应该只存在于细胞的外膜上. 至少功能性的NMDA受体是存在于细胞膜上的.
膜蛋白的提取是存在一个Marker的问题, 就是有什么指标能证明提出来只是膜蛋白呢?
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bohe221[使用道具]
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是不是可以做存在于总蛋白而膜上没有的蛋白的western来证明呢?但是我现在还不知道那些蛋白膜上存在与否,如actin,作为很多时候很多蛋白的内参,我发现SCI的论文中很多论文做NMDA受体是没有提示内参,而极少数论文提示了actin条带。
我原来以为是不是因为NMDA的分子量太大以至不好同时看actin的,但是我自己做western时发现在同一张胶上可以保留NMDA和actin的条带,现在想起来他们没做actin会不会另有其因?比如说膜上的actin并不多等等…………
这只是我的假设,还什么都不能确定。
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feima+[使用道具]
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最近又有战友发过类似问题, 如下方法:
The membrane and cytosolic fractions were prepared as described (Souza & Ramirez, 1991) with minor modifications. Briefly, cerebral cortex was homogenized in 5 volumes of ice-cold homogenizing buffer containing 20 mM Tris–HCl buffer (pH 7.4), 1 mM DTT, 5 mM EGTA, 2 mM EDTA, 10% glycerol, 1 mM MgCl2, 1 mM PMSF, 2 μg/ml of leupeptin, and 2 μg/ml of aprotinin by dounce homogenizer with the use of pestle ‘B’ (Wheaton Scientific, Millville, NJ, USA), which allows disruption of tissue without disrupting the nuclei. The homogenate was centrifuged twice at 1,000 g for 15 min, and the pellet was discarded. The supernatant was further centrifuged at 27,000 g for 1 h at 4°C, and the supernatant was designated as the crude cytosolic extract. The pellet was resuspended in homogenizing buffer containing 0.5% Triton X-100, incubated for 1 h at 4°C, and centrifuged at 27,000 g for 30 min. The supernatant obtained from this centrifugation was designated as enriched membrane fraction. Protein content was assayed by the method of Bradford, M.M., 1976. A rapid and sensitive method for the quantitation of microgram quantities of protein utilizing the principle of protein-dye binding. Anal Biochem 72, pp. 248–254. Abstract | View Record in Scopus | Cited By in Scopus (75143)Bradford (1976).
源文献:
Effect of prenatal and postnatal ethanol exposure on Ca2+ /calmodulin-dependent protein kinase II in rat cerebral cortex.Mahadev K, Chetty CS, Vemuri MC.Alcohol. 2001 Apr;23(3):183-8
以上贴出自: cuturl('http://www.dxy.cn/bbs/post/view?bid=65&id=14454881&sty=1&tpg=1&age=0')
可以试试看, 至少有了参考文献. 呵呵.
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提取膜蛋白的试剂盒,要多少钱啊
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dhpbj[使用道具]
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好像是250来美元。
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