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标题:【求助】求助胞外蛋白的提取方法

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【求助】求助胞外蛋白的提取方法


大家好,有谁做过分泌表达么?我做的是分泌表达,胞外蛋白部分总是没有条带出现,感觉还是提取蛋白的方法有问题,这个问题已有半年没解决,真是太闹心了。请大家帮帮忙!
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shanzhapia696[使用道具]
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首先有没有表达 如果没有 和纯化无关
换个载体和菌株试试 时间不等人啊
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gogo[使用道具]
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分泌表达只要平台成熟,应该还不是那么难做的,你是做酵母表达还是什么系统,胞外的蛋白提取一般都是通过TCA沉淀浓缩的方法啊,蛋白如果不经过浓缩,浓度很低,直接跑胶一般都是不能呈现出条带的,除非你蛋白表达量特别高。
你可以把你提取蛋白的方法贴上来大家一起讨论,可能方法上有点问题吧。
另外,为方便讨论,你最好把一些背景知识稍做介绍,比如用什么宿主,什么载体,表达什么样的蛋白(原核or真核)等等,这样说不定在这个院子里一讨论就能找到问题的所在。
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我做的是在乳酸菌中表达蛋白,属于原核表达,我提取胞外蛋白的方法是离心,取上清1.7ml,加入300ml 100%的TCA,冰上放置10min,离心取沉淀。用这种方法最后就看不到蛋白,不知道是我的蛋白表达量低还是方法不对。
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baidukk[使用道具]
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在乳酸菌中表达蛋白我没有做过,不过蛋白提取方法应该是一样的,应该是你输入错误吧,1.7ml上清加入300ul100%TCA吧。
我一般做的体系比你大一点,比如9ml培养物,10,000G离心20min,取上清在过0.22um的滤膜,防止污染菌体,后面收集的上清中加入1ml100%TCA,终浓度是10%,4度沉淀4-8h,有时候也过夜,我有看过说-20度沉淀过夜的,我试过,液体冻起来了,感觉效果不是很好,但感觉你沉淀的时间太短了,延长时间看看。沉淀完后10,000G离心30min,小心去掉上清,这时就能看到沉淀,再加入2ml丙酮洗一遍,晾干去除丙酮,再用一定体积的TE溶解(一般浓缩100倍,9ml上清到90ulTE)。
感觉你说的方法不是很完整,可能主要的原因还是沉淀时间太短,沉淀完离心等步骤都有吧,你参考我上面写的方法,把你的方法稍作改进,再来吧,应该能跑出条带的,即使目的蛋白没表达,也会有菌体自身分泌的蛋白的,实验就是这样,反反复复,只要每次条件有点改变,不是简单的重复就好,结果总会出来的。
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十分感谢楼上的建议,还有一些细节方便想问问
1.你在加入TCA沉淀离心后看到的沉淀是什么颜色的,是培养基的颜色么?÷沉淀量多么?
2.丙酮洗后,具体怎么晾干,大概需要所长时间?
3.最后的TE就是咱们经常使用的TRIS-HCL吧,加上这个之后,上样缓冲液直接加就行么?
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不好意思,有写错了。TE是TRIS-EDTA吧?
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jujuba[使用道具]
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沉淀的颜色是白色的,有点偏黄吧,也不完全是培养基的颜色,要浅一点。沉淀的量还可以吧,可能和我提取的蛋白有关,有几种蛋白本身量还比较大,不过你要注意,你所看到的沉淀并都是蛋白,所以即使你看到的沉淀量多,也并不代表你获得的蛋白就多。
丙酮洗了之后就离心去掉上清,室温干燥啊,时间要根据你沉淀的量来看,你自己肉眼看里面沉淀干了就差不多了,一般半小时吧,跟提质粒晾干酒精一样,自己估计就行,你注意也不要放的时间太长了,干的太厉害后面用不太好溶。
溶解用的溶液没什么严格要求,根据你的实验来定,TE可以,PBS也可以,有时候蛋白不是很好溶,我就直接用2*上样buffer来溶,反正都行吧,只要蛋白能溶解,这部可能会出现的问题是有些沉淀不是很好溶,你可以放37度处理一下促溶,也可以用枪吹打等,另外上样buffer原本是蓝颜色的,但加到沉淀中后可能会变成黄颜色,这是因为沉淀中TCA没有完全去除,改变了溶液的pH,讨论这个的帖子在院子里也有,大家比较认可的是这个pH的改变对后续跑胶没什么影响,但我一般还是加一点点浓度很低的NaOH(10mM)来把颜色调成刚刚变成蓝色。再跑胶。
我现在想到的就这么多了,供你参考吧,希望你好运,呵呵。
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我按照你的建议重新提取了蛋白,最后可以看见发黄的沉淀,真的好高兴呀。但有没有我要表达的蛋白就不知道了,还得接着蛋白电泳才能检测。很感谢你的建议。谢谢!
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今天做完了蛋白电泳,诱导之前的胞外蛋白部分有该菌本身的管家蛋白相应条带出现;而诱导之后的部分,该管家蛋白条带很弱,几乎看不到,而且也看不见目的蛋白,有可能是表达量太低,蛋白水平看不到吧。乳酸菌的表达量一般都比较低,这还需要继续做West blot看结果。不过,至少说明了你说的胞外蛋白提取方法是有效的,终于提出了蛋白,这点也是值得庆贺的。谢谢指教!
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