蛋白质与蛋白组学 » 讨论区 » 经验共享 » 【求助】请帮忙分析一下2-DE胶图

采购询价

点击提交代表您同意 《用户服务协议》 《隐私政策》

 
需要登录并加入本群才可以回复和发新贴

标题:【求助】请帮忙分析一下2-DE胶图

dream2013[使用道具]
三级
Rank: 3Rank: 3


UID 103463
精华 0
积分 250
帖子 200
信誉分 100
可用分 1806
专家分 0
阅读权限 255
注册 2013-1-11
状态 离线
1
 

【求助】请帮忙分析一下2-DE胶图


pH3-10 左端为酸性端,无Marker
Step1  30  S  time:  10:00
Step2  200  G  time:  02:00
Step3  500  G  time:  02:00
Step4  1000  G  time:  01:00
Step5  5000  G  time:  01:00
Step6  10000  G  time:  01:00
Step7  10000  S  Vh:  60000
Step8  1000  S  time:  01:00
Step9  0  S  time:  00:00
请高人帮忙解析,不胜感激!


查看积分策略说明
附件
2014-2-3 23:51
55586483.snap.jpg (24.46 KB)
 
顶部
BUK[使用道具]
四级
Rank: 4


UID 74485
精华 0
积分 521
帖子 701
信誉分 100
可用分 4361
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-10-11
状态 离线
2
 
个人觉得是蛋白提取问题,蛋白溶解的不好,有核酸等污染!请将你的材料、提取方法、上样量、聚焦情况等详细说一下,才好去具体分析!!
顶部
dream2013[使用道具]
三级
Rank: 3Rank: 3


UID 103463
精华 0
积分 250
帖子 200
信誉分 100
可用分 1806
专家分 0
阅读权限 255
注册 2013-1-11
状态 离线
3
 
材料:古菌
提取方法: cells were harvested from a 100 mL culture and
washed twice in 3 volumes w/v 1.5 M Tris-HCl buffer at
pH 7.1. Cells were resuspended in 3 volumes w/v 50 mM
Tris-HCl buffer at pH 7.1 supplemented with 0.8% SDS and
phosphatase and protease inhibitor cocktails according to the
supplier.cells homogenized by sonication,the lysate
was centrifuged (15 600 3 g, 20 min, 47C). The supernatant
was boiled (5 min), chilled on ice (5 min), and centrifuged
(15 600 3 g, 30 min, 47C). The sample was resuspended in 0.5 mL 250 mM glycerol
supplemented with 10 mM TEA prior to dilution.
上样量:300ug
IEF:Step1 30 S time: 10:00
Step2 200 G time: 02:00
Step3 500 G time: 02:00
Step4 1000 G time: 01:00
Step5 5000 G time: 01:00
Step6 10000 G time: 01:00
Step7 10000 S Vh: 60000
Step8 1000 S time: 01:00
顶部
Ao7[使用道具]
四级
Rank: 4


UID 76545
精华 1
积分 647
帖子 790
信誉分 102
可用分 4976
专家分 10
阅读权限 255
注册 2011-11-7
状态 离线
4
 

个人觉得还是蛋白提取的问题,可试着加超声波破碎改进一下提取方案!
顶部
kuohao17[使用道具]
四级
Rank: 4


UID 77299
精华 0
积分 559
帖子 716
信誉分 101
可用分 4453
专家分 10
阅读权限 255
注册 2011-11-15
状态 离线
5
 

酷似我们之前跑出来的电泳图就是这个样子的,后来改用试剂盒纯化了下,就没有这种状况了,应该还是样品处理的吧
顶部
vvmmoy[使用道具]
四级
Rank: 4


UID 79224
精华 0
积分 825
帖子 1270
信誉分 100
可用分 7255
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-12-8
状态 离线
6
 
样品处理有问题,加SDS是不行的,最好使用CLEAN-UP处理一下。会去除一些不必要的影响因素,然后用冲水化液溶解。电泳。
顶部
dream2013[使用道具]
三级
Rank: 3Rank: 3


UID 103463
精华 0
积分 250
帖子 200
信誉分 100
可用分 1806
专家分 0
阅读权限 255
注册 2013-1-11
状态 离线
7
 

SDS会对2-D图有很大影响吗?
顶部
8princess8[使用道具]
四级
Rank: 4


UID 75310
精华 1
积分 664
帖子 821
信誉分 103
可用分 5056
专家分 20
阅读权限 255
注册 2011-10-21
状态 离线
8
 

主要是样品不够干净
顶部