小中大这个问题像问单级四极杆和串联四极杆一样，是一个单级质谱和多级质谱的差别问题。
（1）更多信息的需要：液质联用，单级质谱基本只有分子量的信息，没有结构信息。所以，要想得到更多的信息，一定得用多级质谱。
（2）防止共流出物干扰谱图的需要：比如蛋白质组学等复杂样品分析，如果没有多级质谱，你是无法得到干净的多肽碎片谱图的。因为共流出物的信号可能很强，又刚好不是你想要的那个样品的信号。单级质谱，没有进一步按质量分离、再碎裂的功能。
（3）痕量定量的需要：如果你测定的是残留物，就必须用多级质谱。也是因为它可以分离出你要的离子，再碎裂，用MRM定量。这样，定量的那个峰，就是准的，它不会包含你不想要的干扰离子。
当然，如果你只做标样，只做样品中的主成分，基质又不复杂。你完全可以用单级质谱。而TOF的好处就是可以获得高分辨，并获得高的质量准确度。
