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标题:【求助】已知引物 怎末知道扩增片段的长度

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发表于 2014-2-10 17:34 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

【求助】已知引物 怎末知道扩增片段的长度


已知引物 怎末知道扩增片段的长度
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any333[使用道具]
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发表于 2014-2-10 17:35 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
相关疾病：
电击伤
在cuturl('http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi') 先 点击 nucleotide blast 并进入
然后输入 你的引物对
接着选择你的基因所在的种属。然后点击 下端 Blast 等候， 约几秒钟后， 会出现一个画面，下拉，找你所对应的种属的基因。看看是不是100% 吻合，然后计算就可以了
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rxcc33[使用道具]
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发表于 2014-2-10 17:35 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

如果这是个新基因呢
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eric930[使用道具]
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发表于 2014-2-10 17:36 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

那请问你的引物是怎么设计的。是random primer 吗？如果是，那估计得sequencing 了吧
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rxcc33[使用道具]
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 小中大

在你设计的因无所对应的目的sequence上的位置有标记，两个引物所对应的位置相减就得出你想要扩增的条带的长度。一定要看清 plus & minus
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发表于 2014-2-10 17:37 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

引物不是我设计的 是文献上的 我就是想知道他的引物 扩增的片段 是多少 但是不会计算呀
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rxcc33[使用道具]
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发表于 2014-2-10 17:37 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

要不，你告诉我引物序列， 和基因的种属，我帮你找完，告诉你结果网页
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发表于 2014-2-10 17:38 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

PPARγ 大鼠
5-TGAAGGCTCATATCTGTCTCCG-3
5-CATCGAGGACATCCAGCAAC-5
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 小中大

Mechanisms of anti-inflammatory and neuroprotective actions of PPAR-gamma agonists
Kapadia R, Yi JH, Vemuganti R.
Front Biosci. 2008 Jan 1;13:1813-26.
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rxcc33[使用道具]
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发表于 2014-2-10 17:40 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

cuturl('http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi')
第一个：primer 位置是：primer 1--> 1530bp-1509bp
primer2-->1348bp-1362bp
所以PCR 扩增片断是：1530-1348= 182bp
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