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标题:【求助】低温促进包涵体表达?

xingyi08[使用道具]
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【求助】低温促进包涵体表达?


在大肠杆菌BL21(DE3)做膜蛋白(26KD, 6个跨膜片段)和麦芽糖结合蛋白(MBP)融合表达, 发现融合蛋白都是于包涵体的形式表达, western blot只能检测到极少量的表达.但后续的实验比较奇怪, 不好解释,希望高手帮忙给点建议
作了不同温度梯度的融合表达,发现温度越低,形成的包涵体越多(30度时是40度的5倍多,是37度3倍左右, 而25度, 30度,34度表达水平差不多). 而且诱导后菌体密度也差不多(OD600在3.8--4.1之间),上清蛋白总浓度也几乎一样.应该说可以排除目标蛋白表达引起的细胞毒性的因素,另外蛋白酶活性应该不会这么明显吧?
还有就是温度越高,尿素重悬后剩下的沉淀含有的融合蛋白也越多,所以最初的想法是目标蛋白只能于包涵体的形式表达,而且可能高温条件促进蛋白聚集体的形成.但好像也解释不通,融合蛋白总量和低温的相差还是非常明显.假如大肠杆菌内形成这样的聚集体,应该不会抑制蛋白的表达吧?
想不到其他原因可以解释了,不知道有没类似经历的高手,希望大家帮帮忙阿
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yonger[使用道具]
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包涵体形成与很多因素有关
1。一般来说,温度越高,转速越大,越有利于包涵体的形成。而且蛋白越大,越不好折叠,就越容易出现包涵体。28度,长时间的温和摇菌,可有效减少包涵体的形成,这是常用的方法。
2。就你的情况看,既然是膜蛋白,那么本身一定有很强的疏水结构域,也就不难理解为什么一直会有包涵体了。
我想可以28度,IPTG减半,150-180转温和摇菌试一试。
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xingyi08[使用道具]
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QUOTE:
原帖由 yonger 于 2014-2-13 10:53 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')

包涵体形成与很多因素有关
1。一般来说,温度越高,转速越大,越有利于包涵体的形成。而且蛋白越大,越不好折叠,就越容易出现包涵体。28度,长时间的温和摇菌,可有效减少包涵体的形成,这是常用的方法。
2。就你的情况看,既然是膜 ...


以前做融合表达 结论和你的一样
25度都试过了 全部是包涵体
现在问题关键是解释为什么温度低 包涵体多??
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tie8[使用道具]
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我觉得不能用大肠杆菌不大,即使表达出来是可溶,没有活性的可能性也挺大
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我觉得你的温度可以在低一点.
或者,你需要考察一下这个蛋白折叠的时候,有没有分子伴侣等等
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我最近也是在做膜蛋白的表达,刚刚完成其中一个,且疏水性>亲水性,二级结构显示很少螺旋,没有问题,可溶性表达量很大,且已经纯化,结果很好。你的表达菌 诱导后菌体密度也差不多(OD600在3.8--4.1之间),肯定是包涵体了,那么大的OD。所以请你详细说明一下,你的诱导过程。
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我觉得你的温度可以在低一点.
或者,你需要考察一下这个蛋白折叠的时候,有没有分子伴侣等等

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我觉得不能用大肠杆菌不大,即使表达出来是可溶,没有活性的可能性也挺大

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我觉得上面的两种可能是有的。
建议:改造改造过的南极油螺旋菌属(Oleispira) ,4-12°C低温表达减少包涵体
是否可以考虑利用Stratagene公司的 ArcticExpress感受态细胞解决,表达分离于南极Oleispira antarctica的分子伴侣(cpn60, cpn10)有助于折叠减少inclusion bodies的量:”Chaperonins are known to facilitate proper protein folding by binding to and stabilizing unfolded or partially folded proteins. Chaperonins Cpn60 and Cpn10 show high protein refolding activities at temperatures of 4-12°C. When expressed in our ArcticExpress competent cells, these chaperonins enhance the cells' ability to grow at lower temperatures and properly process recombinant proteins, thus increasing the amount of available soluble protein (Figure 2).“
cuturl('http://www.stratagene.com/products/displayProduct.aspx?pid=796')
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xingyi08[使用道具]
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我最近也是在做膜蛋白的表达,刚刚完成其中一个,且疏水性>亲水性,二级结构显示很少螺旋,没有问题,可溶性表达量很大,且已经纯化,结果很好。你的表达菌 诱导后菌体密度也差不多(OD600在3.8--4.1之间),肯定是包涵体了,那么大的OD。所以请你详细说明一下,你的诱导过程。

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我用的SOC培养基 不诱导的话OD很容易达到5.0以上的
我的膜蛋白有6个跨膜片断 疏水性很强
和MBP融合表达本来是为了减少疏水性 减少毒性
结果毒性是降低了 疏水性似乎没什么变化
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xingyi08[使用道具]
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我觉得上面的两种可能是有的。
建议:改造改造过的南极油螺旋菌属(Oleispira) ,4-12°C低温表达减少包涵体
是否可以考虑利用Stratagene公司的 ArcticExpress感受态细胞解决,表达分离于南极Oleispira antarctica的分子伴侣(cpn60, cpn10)有助于折叠减少inclusion bodies的量:”Chaperonins are known to facilitate proper protein folding by binding to and stabilizing unfolded or partially folded proteins. Chaperonins Cpn60 and Cpn10 show high protein refolding activities at temperatures of 4-12°C. When expressed in our ArcticExpress competent cells, these chaperonins enhance the cells' ability to grow at lower temperatures and properly process recombinant proteins, thus increasing the amount of available soluble protein (Figure 2).“
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good idea 谢谢
不过估计老板不会让我买菌种的了
lz有该菌株否? 可以交换
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DNA[使用道具]
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我用的SOC培养基 不诱导的话OD很容易达到5.0以上的
我的膜蛋白有6个跨膜片断 疏水性很强
和MBP融合表达本来是为了减少疏水性 减少毒性
结果毒性是降低了 疏水性似乎没什么变化

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控制OD太容易了吧?这个很重要,我最近纯化的那个蛋白,低OD比高OD可溶性表达量大的多的多,另外一个蛋白37度比低温表达量高,虽然表达量也不是很大。
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