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标题:【求助】beta-actin条带清楚,却没有目的条带

mogu[使用道具]
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1
 

【求助】beta-actin条带清楚,却没有目的条带

请问beta-actin有条带,却没有目的条带是哪些方面所致?
我的实验步骤如下:
1.提取组织总蛋白的裂解液如下:
单去污剂裂解液(50mmol/L Tris•HCl pH8.0,150mmol/L NaCl,1%TritonX-100,100ug/ml PMSF):
1mol/L Tris•HCl(pH8.0) 2.5ml
NaCl 0.438g
TritonX-100 0.5ml
蒸馏水至 50ml
混匀后, 4℃保存。使用时,加入PMSF至终浓度为100ug/ml(0.87ml裂解液加入1.74mg/ml PMSF50μl)。
2.40%Acr/Bic,积层胶(60v)是5%,分离胶(90v)是12%.分子量是53,35,17kDa
3.转膜(250mA恒流)
分子量是57:1h和2h都做过
分子量是17:转膜50分钟
4.一抗37度两小时,二抗37度一小时,都是TBST洗三次,各5-10分钟
(注:师兄师姐用过的抗体,时间最少一年)
5.显色后,分子量57kDa,35kDa,17kDa都没条带(一点迹象都没有)。只有beta-actin有条带。
什么原因呢?
1.样品提取?样品中有内参,是不是一定就有目的蛋白呢?
2.还是抗体?二抗应该没问题吧?
急盼!
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jingling845[使用道具]
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2
 
我觉得有以下几个方面需要考虑:
1 你的目的蛋白在组织中的表达量,如果本身就表达很低,就可能检测不出来。
2 既然你内参作出来了,说明样品提取中出现的问题不大,但也不能完全排除目的蛋白降解的可能。转膜充分很关键,你最好用丽春红染色看看目的蛋白有没有充分转到膜上。
3 封闭一定要充分,也是比不可少的。
4 如过以上都没问题,应该就是抗体的问题了,如果你用的抗体原来就稀释好的,效价肯定会降低,最好加大抗体浓度。
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mogu[使用道具]
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多谢指点!
1.样品提取没什么问题我就放心啦
2.染胶(没加marker)后看到好多条带,但不知道是否是我需要的。
3.转膜不管用多长时间,感觉胶上的蛋白都差不多,大部分都转过去了,显色后却没条带
4.抗体是我最近稀释的,按说明书取中间值
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lixi559[使用道具]
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4
 
楼上有三个问题要注意
1.内参可以做出来并不代表标本没问题,因为内参的表达量很大,就算标本降解了,用ECL这种灵敏度高的检测方法还是可以轻松做出来。我就试过标本煮沸变性后,在常温下放了两周,然后做WB,仍可以做出来内参,不过随标本降解,条带略模糊。但目的条带基本就看不到了。
2.转膜条件:从你的实验结果看,分子量最小的没做出来,很有可能是恒流转膜电压过高,转的过了头,建议调整为恒压45v,低温转80min,此条件我做出过15k的。
3.抗体孵育,国外的抗体多建议4摄氏度摇床过夜,你孵育时间可以试着延长下。
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kewanqi2011[使用道具]
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5
 
你可以先测一下蛋白浓度吧,或许加大上样量再看看。
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mogu[使用道具]
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首先非常感谢各位!
1.请问有人用过我提取组织的裂解液吗?在网上查的不知如何
2.测蛋白浓度:Bradford
样品(3ul)+生理盐水(57ul)+G-250(3ml),测得浓度再乘以稀释倍数20,即为每微升的浓度:12ug/ul 上样量为80ug
不知上述方法对吗?
样品:2*上缓=1:1(各样品用蒸馏水配成等体积),
3.我是所有的目的蛋白都没出来.恒流(250mA)时电压是100v
4.今天做的western电泳同前:60v.90v,两小时就跑完啦,是不是太快啦
请问你的转膜是半干转吗
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mogu[使用道具]
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7
 
请教:
1.上样缓冲液室温下保存多久?过期会对什么有影响?
2.丽春红染色结束必须用水洗掉?与蛋白怎么结合的?还有颜色的话会影响抗体的结合吗?
3.封闭后用水洗3次×5分钟可以吗
多谢
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mogu[使用道具]
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请教各位:
1.怎么检测样品有没目的条带
2.怎么检测一抗有没问题,做阳性对照吗?怎么做?
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ha111[使用道具]
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跟我刚开始做WB的情况一样。我的目的蛋白是:57KD和30KD
可能的问题:
1.蛋白提取和保存:对于提组织蛋白来说,个人感觉单去污对蛋白酶抑制的强度不够,我另外还加了两种蛋白酶抑制剂;即使如此,有的样品冻融过一次就出现过降解的情况。所以建议提蛋白时,加酶抑制剂(Roche有片剂,溶解了可以直接用的,我们实验室就用的这种,可惜我没用上);并且分装最好保存在-70,天气热,-20冰箱不是你一个人用,有的人打开了好久也不关,你的样品就遭殃了。
2.上样量的问题:似乎很多人都忽略了。如果目的表达丰度低,所提样品的浓度又不高的话,一般的50微克是做不出来的。我的57KD蛋白,就需要上150微克才做出来很细的条带。
3.转膜的过程:这个过程最需要耐心。针对你实验室的现有条件,优化转膜条件。我57KD用的是恒压100V,转1h40min,0.2微米的PVDF膜。还有就是膜也很重要,刚开始我用的是NC膜做30KD的,转膜条件变了好多都做不出,换了膜就OK了,现在上10微克也很强的条带。
4.一抗的问题:时间久了效价会下降这是肯定的,关键在于下降了效价是不是在提高了一抗浓度能得到补偿。要证实这个问题,你需要做阳性对照,即找一种肯定表达目的蛋白的组织或细胞,用这个一抗做一次就明了了。但是提高一抗浓度势必会增加背景,有时候不得以而为之,先做出目的再调整条件。
5.二抗的问题:你的目的和内参用的是同样的二抗吗?如果不是还需要排除二抗的问题,这个简单些,问别人要一点同样的二抗做一次就可以了,就用同一张膜!
6.发光液:如果你的内参发光速度比较慢,还要怀疑发光液是否不好了。我就遇到这个情况。如果你已经排除了以上我所说的1-5点情况,可以试试增强型发光液,就是贵一点,但确实发得很快,比较省一抗。
如果还有别的问题,请其他的战友补充!
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10
 
跟我刚开始做WB的情况一样。我的目的蛋白是:57KD和30KD
可能的问题:
1.蛋白提取和保存:对于提组织蛋白来说,个人感觉单去污对蛋白酶抑制的强度不够,我另外还加了两种蛋白酶抑制剂;即使如此,有的样品冻融过一次就出现过降解的情况。所以建议提蛋白时,加酶抑制剂(Roche有片剂,溶解了可以直接用的,我们实验室就用的这种,可惜我没用上);并且分装最好保存在-70,天气热,-20冰箱不是你一个人用,有的人打开了好久也不关,你的样品就遭殃了。
2.上样量的问题:似乎很多人都忽略了。如果目的表达丰度低,所提样品的浓度又不高的话,一般的50微克是做不出来的。我的57KD蛋白,就需要上150微克才做出来很细的条带。
3.转膜的过程:这个过程最需要耐心。针对你实验室的现有条件,优化转膜条件。我57KD用的是恒压100V,转1h40min,0.2微米的PVDF膜。还有就是膜也很重要,刚开始我用的是NC膜做30KD的,转膜条件变了好多都做不出,换了膜就OK了,现在上10微克也很强的条带。
4.一抗的问题:时间久了效价会下降这是肯定的,关键在于下降了效价是不是在提高了一抗浓度能得到补偿。要证实这个问题,你需要做阳性对照,即找一种肯定表达目的蛋白的组织或细胞,用这个一抗做一次就明了了。但是提高一抗浓度势必会增加背景,有时候不得以而为之,先做出目的再调整条件。
5.二抗的问题:你的目的和内参用的是同样的二抗吗?如果不是还需要排除二抗的问题,这个简单些,问别人要一点同样的二抗做一次就可以了,就用同一张膜!
6.发光液:如果你的内参发光速度比较慢,还要怀疑发光液是否不好了。我就遇到这个情况。如果你已经排除了以上我所说的1-5点情况,可以试试增强型发光液,就是贵一点,但确实发得很快,比较省一抗。
如果还有别的问题,请其他的战友补充!
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太谢谢你了!
1.肾脏组织是去年取的,今年三月提的蛋白,可能是时间长的问题,也可能是裂解液的问题。我也考虑换成三去污裂解液提取蛋白。
2.我刚做了一次上样量是180ug,膜上只有大分子量,但不是很清楚(250mA,50分钟)。小分子量是一片,但是冻融过一次(前一天测得浓度),降解有这么快吗?转膜是转过了,但也不会这样吧,一点都没有。
3.膜是0.2um的硝酸纤维素膜应该还可以

4.是同一个二抗
5.TMB显色:内参5分钟即可
现在估计样品和一抗的问题。
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