【求助】小分子多肽可以用MALDI-TOF分析吗？

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标题:【求助】小分子多肽可以用MALDI-TOF分析吗？

boom[使用道具]
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发表于 2014-2-27 17:09 资料个人空间短消息加为好友

小中大

我纯化了一个未知功能的小分子肽，1000Da左右，是否可以用MALDI-TOF来鉴定是什么蛋白吗？还是ESI可以呢？

kuaizige[使用道具]
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发表于 2014-2-27 17:10 资料个人空间短消息加为好友

小中大

QUOTE:

原帖由 boom 于 2014-2-27 17:09 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
我纯化了一个未知功能的小分子肽，1000Da左右，是否可以用MALDI-TOF来鉴定是什么蛋白吗？还是ESI可以呢？

可以的。

kuaizige[使用道具]
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发表于 2014-2-27 17:21 资料个人空间短消息加为好友

小中大

QUOTE:

MALDI-TOF来确定分子量。

DONT[使用道具]
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发表于 2014-2-27 17:22 资料个人空间短消息加为好友

小中大

要测序必须MS/MS，这个分子量是没有问题的

boom[使用道具]
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发表于 2014-2-27 17:23 资料个人空间短消息加为好友

小中大

我用MS/MS测出来多肽的氨基酸序列为CSCEEPDC，请问是否有网站可以查这个多肽是什么物质呢？

remenb[使用道具]
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发表于 2014-2-27 17:23 资料个人空间短消息加为好友

小中大

blast

boom[使用道具]
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发表于 2014-2-27 17:23 资料个人空间短消息加为好友

小中大

请教sarlett，blast查询这么短的序列是否有难度？而且只有这么一个序列而已。。

wood533[使用道具]
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发表于 2014-2-27 17:24 资料个人空间短消息加为好友

小中大

试试看吧，应该没问题的，8个氨基酸的特异性已经很强了。但是你要确定你de novo的序列是正确的。

boom[使用道具]
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发表于 2014-2-27 17:29 资料个人空间短消息加为好友

小中大

得分多少算可以啊，我的得分96，应该算比较高了吧？