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标题:转帖 我对LC-MS定性的一点看法

dingdang[使用道具]
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转帖 我对LC-MS定性的一点看法

对于生物分子,热不稳定化合物,有机盐等,EIMS就不好用了,而ESI/MS/MS等软电离源是很好的选择.

在进行LC/MS和/或ESI定性时,应该对所研究的样品心中有数,特别是分子骨架,可能的取代基等,当然,文献资料是应该具备的。

有一个朋友合成一个药物,产物杂质鉴定(NMR没有有意义的杂质峰)时从LC/MSMS中得到一个杂质(含量很低),让我帮助分析。产物的结构已知,分析结果是产物脱去了一个基团,形成共扼结构。

MS不祥NMR那么直接,一个样品在样品管里可以做十几个/或几十种图谱.互相补充和印证,MS是数字和结构片段离子之间的联系,这种联系是需要经验(和文献)的。

有人说MS是马后炮。话是过分了点,也有几分道理。其它波谱也不是万能的,用NMR做药代,恐怕远不如LC/MS/MS好。

数据库问题,下次再谈吧。
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的确核磁在结构确认上有着先天优势,

H谱,C谱,P谱,F谱等可以看出结构关系,另外,二维谱,NOE 等可以进一步确认结构,的定性上NMR是上上之选。

LC-MS/MS只能做一些确认的工作,如果同分异构的话也很难确证,但NMR可以很简单的办到。不过NMR有一点不足的就是对样品的纯度有要求,没有90%很难进行解谱,特别是反应过程的负产物很难确证!虽然有制备与核磁联用的仪器,但毕竟用户是少数,而且对量的要求比较多。Mass在对一般性的定性问题上有快速、简便、对纯度要求不高等特点,但真正的解谱专家是NMR,Mass只是一种佐证而已。

不过Mass 的灵敏度在定量上确实很好,不过ESI 在基质效应影响分析结果的重现性上又带来RSD 偏大,甚至要每天做标准曲线的问题,总之也不是很理想。但API 技术发展起来也就十几年,相信随着技术的发展,LC-MS技术上会更成熟,应用范围会更广泛。
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另外,高分辨质谱,如双聚焦质谱仪,傅立叶变换质谱仪,带反射器的飞行时间质谱仪 可以精确的测定化合物的分子式,其快速简便也是NMR所不能及的。
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zhangsan[使用道具]
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偶是新手,很想听你说说LC-MS的数据库方面的东西。
1)平时用LC-MS得到的图是什么图?
2)是不是跟GC-MS得到的图是一样的(TIC图和棒图)?
3)得到一个未知物的棒图后,怎么对它定性?是对照以前自己作过的(建立的)谱库,还是只看棒图来推测它是什么? [/size=3]
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LC-MS 的图谱和 GC-MS的是一样的,区别在于一个是液相入口,一个是气相入口;在Mass数据上没有任何区别。

对于未知化合物的棒图,我们只能知道准分子离子峰和一些碎片情况,如果对样品有一定了解,可以通过分子量和碎片信息,推测一些可能的化合物。如果要定官能团等,LC-MS不如GC-MS,而且,LC-MS也没有通用的谱库,要想根据棒图来检索可能的化合物很难。但,自己可以建立谱库,然后索引。所以在谱库上,LC-MS是远远落后于GC-MS。
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未知物的MS图谱解析(包括未知物NMR/IR的解析)是比较棘手的。我的经验是:
1.解析MS图谱时,首先确认分子离子峰,也就是确定分子量。最好高分辨MS测定分子式。
2.由分子离子峰区结合低质量区推断取代基,特别要看有没有互补离子。有经验者可以由特征离子群判断分子骨架类型。
3.从样品的来源途径获得分子骨架信息。非常重要!
4.你研究的化合物的文献数据。
5.尽可能检索数据库。
6.确实解不了,即时想专家请教。
7.不要轻易单独靠MS断定结构,和NMR、IR结合分析。
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zhangsan[使用道具]
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个人认为,串联离子阱在生物领域的应用前景最为广阔。
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原帖由 zhangsan 于 2007-8-10 00:16 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
个人认为,串联离子阱在生物领域的应用前景最为广阔。

离子阱分析质量上限20000多一点,你怎么能说它最为广阔呢?大于20000以上的蛋白它都抓瞎,而且,串联离子阱这个叫法也不太妥当,离子阱主要还是在小结构化合物的结构定性上,它可以打个多级验证一下结构,理论是十级,其实打到4、5就差不多了。
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zhangsan[使用道具]
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原帖由 mass 于 2007-8-10 00:17 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')


离子阱分析质量上限20000多一点,你怎么能说它最为广阔呢?大于20000以上的蛋白它都抓瞎,而且,串联离子阱这个叫法也不太妥当,离子阱主要还是在小结构化合物的结构定性上,它可以打个多级验证一下结构,理论是十级,其实打到4、5 ...

四级杆串联(线性)离子阱确实把四级杆和离子阱的优点都集成在一起了,当然,检测的质量范围确实有点遗憾!但是,仪器检测的是M/Z,离子阱是在四级杆后面的,而四级杆是很少能超过3000的。但,对于蛋白,可以形成多电荷离子,从而扩充了四级杆的应用范围,离子阱也一样啊!不同的仪器有不同的用途,对于气质来说,能检测到1000有意义吗?
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mass[使用道具]
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原帖由 zhangsan 于 2007-8-10 00:17 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')

四级杆串联(线性)离子阱确实把四级杆和离子阱的优点都集成在一起了,当然,检测的质量范围确实有点遗憾!但是,仪器检测的是M/Z,离子阱是在四级杆后面的,而四级杆是很少能超过3000的。但,对于蛋白,可以形成多电荷离子,从而扩充了四 ...

我的观点是:离子阱的质量上限限制了它在生物领域的一些应用,所以我认为它不能说在生物领域具有"最"广阔的前景,是针对那位朋友观点的,你老是用引申别人观点做什么,我说的话跟"气质检测到1000"有什么关系,加多少个电荷能扩充的问题,在很多情况下,必须降到一定酸度才可以保证加上足够多的氢正,加上足够多的氢正才能进入M/Z测定范围(离子井或四极杆的),很多应用在药物和蛋白相互作用,或者蛋白-蛋白相互作用,蛋白-核酸相互作用时,pH并不是随心所欲的可以降,起码我尝试的几个都不可以降太厉害,个人认为,线性离子阱是炒作之物,并不是说得那么好听的优点集中,这是我的观点,你有什么反对可以说,但是别再啥气质之类的,就事论事好一些。
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