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标题:【讨 论】18KD蛋白的western blot经验

bs4665[使用道具]
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【讨 论】18KD蛋白的western blot经验


本人在做一个18KD蛋白的wb,转膜后预染marker各个条带都可见,不知道就是目的条带都不能曝光出来。内参的B-actin条带清晰,背景也没有。
想请教各位大侠:
1.胞浆蛋白的提取是不是有什么特殊要求。有什么提取方法比较好!
2.18kd蛋白的转膜甲醇的浓度是不是要比较高。
3.其他。。。
希望能够有好的回答,最好能提供好的参考文献。谢谢!
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ritou1985[使用道具]
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1.一般无特殊要求,用试剂盒的话可能会好点,不过很费钱(本人做的是组织蛋白,细胞的不太明白)
2.我作20kD的,甲醇浓度20%,一般来说20%已经是很高了,你可以试试
3.不知道你的膜是什么,最好用PVDF膜,孔径要为0.2μm
4.你是半干转还是湿转。假如是半干的话,时间和电压或电流可能还要再摸索一下
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bs4665[使用道具]
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我现在用的就是试剂盒提取的,现在改用了20%甲醇。由于NC膜0.22的没有到货,所以还是用0.45的做下。我用的是miniVE的垂直电泳,应该是湿转吧。
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redbutterfly[使用道具]
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用15%的PAGE胶跑电泳,注意不要电泳时间太长。
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taoshengyijiu[使用道具]
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【1】你转膜后预染marker各个条带都可见,说明转膜没有问题。
【2】感觉还是用试剂盒好一些。
【3】可以适当减少电泳的时间。
【4】测过蛋白浓度吗?蛋白浓度是多少呀?如果蛋白浓度不是很高,上样量不是很大的话,可以增加上样量,增加蛋白浓度。
【5】增加一抗浓度,增加一抗孵育时间。
【6】增加显色时间。
【7】增加曝光时间,可以曝光很长时间的。
【8】当然是0.2μm的膜好一些,但是18KD的蛋白用0.45的膜也可以的。注意转膜时间不要太长。
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bs4665[使用道具]
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【1】你转膜后预染marker各个条带都可见,说明转膜没有问题。
【2】感觉还是用试剂盒好一些。
【3】可以适当减少电泳的时间。
电泳时间是:积层胶120V、30min。分离胶(15%)用是140-180V,80-120min,转膜是300mA、90-100min。用过两层层叠的NC转膜,使用90min是在marker11KD最小处有小量蛋白转到第二层膜上。
【4】测过蛋白浓度吗?蛋白浓度是多少呀?如果蛋白浓度不是很高,上样量不是很大的话,可以增加上样量,增加蛋白浓度。
我们通过测定OD260和OD280的比值初步决定蛋白浓度,一般都是在3-6mg/ml(应该是这个单位),所测的蛋白表达量也是高表达的,这个蛋白浓度做出来应该没有问题,内参都有很好的表达。
【5】增加一抗浓度,增加一抗孵育时间。
一抗使用的是 Santa Cruz的,在用1:200的时候背景很多,在1:300时就没有什么背景,所以我们选择的是1:300。孵育的时间是4°C过夜,一抗洗涤的时间3X20min,二抗室温下孵育4h,洗涤时间是3X30min。
【6】增加显色时间。
显影用的是ECL试剂盒,国产的,不过检测其他的蛋白都效果很好。一般都是吹打一分多钟
【7】增加曝光时间,可以曝光很长时间的。
曝光时间是20-25min
【8】当然是0.2μm的膜好一些,但是18KD的蛋白用0.45的膜也可以的。注意转膜时间不要太长。
现在使用的是0.45umNC膜
通过上面的实验方法,还是没有检测到蛋白的条带。请问是不是蛋白容易降解的话就不容易检测得到,或是需要通过什么特殊的方法处理蛋白。
还有蛋白的二级构象会不会对蛋白的检测产生影响。
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tangxin_80[使用道具]
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18kd的蛋白应该还算好做。
1。抗体有没有问题?找一个高表达的细胞株作阳性对照。 Santa Cruz的抗体可以用到1:600。
2。我们的条件是电泳80v 30min 120v 120min。具体根据MARKER显示。
转膜 220mA 50min
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bs4665[使用道具]
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相关疾病:
肝癌
我用肝癌组织做过对照,在肝癌组织中它是高表达的。
我所做的是类泛素蛋白FAT10,也叫双泛素,它同泛素一样是介导蛋白的降解。
在许多文献中都检测过它得表达,不知道怎么我们就是做不出来。
感觉转膜还是转上去了的,不知道有什么其他得原因没有!
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fox_79[使用道具]
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【1】你转膜后预染marker各个条带都可见,说明转膜没有问题。
【2】感觉还是用试剂盒好一些。
【3】可以适当减少电泳的时间。
电泳时间是:积层胶120V、30min。分离胶(15%)用是140-180V,80-120min,转膜是300mA、90-100min。用过两层层叠的NC转膜,使用90min是在marker11KD最小处有小量蛋白转到第二层膜上。
你的内参分子量是42KD左右吧?你的目的蛋白的分子量偏小,可以缩短转膜时间,建议试一下300毫安半小时。
【4】测过蛋白浓度吗?蛋白浓度是多少呀?如果蛋白浓度不是很高,上样量不是很大的话,可以增加上样量,增加蛋白浓度。
我们通过测定OD260和OD280的比值初步决定蛋白浓度,一般都是在3-6mg/ml(应该是这个单位),所测的蛋白表达量也是高表达的,这个蛋白浓度做出来应该没有问题,内参都有很好的表达。
蛋白浓度不是很高,不知道你一般上样量是多少,把上样量加到100微克左右试一下,当然也可以适当增加蛋白浓度。
【5】增加一抗浓度,增加一抗孵育时间。
一抗使用的是 Santa Cruz的,在用1:200的时候背景很多,在1:300时就没有什么背景,所以我们选择的是1:300。孵育的时间是4°C过夜,一抗洗涤的时间3X20min,二抗室温下孵育4h,洗涤时间是3X30min。
孵育的时候最好在摇床上进行,这样效果好很多。一抗稀释最好用封闭液(5%的脱脂奶粉)。一抗的洗涤时间可以缩短,一般3×5分钟就可以了。二抗室温摇床上1小时就可以了。二抗洗涤时间3×10分钟就可以了。
【6】增加显色时间。
显影用的是ECL试剂盒,国产的,不过检测其他的蛋白都效果很好。一般都是吹打一分多钟
【7】增加曝光时间,可以曝光很长时间的。
曝光时间是20-25min
这么长的时间一般足够了。如果荧光强,曝光几秒钟就可以了。如果弱,可以把压片暗盒用黑塑料袋包起来,放到抽屉里,然后长时间曝光(几小时)。
【8】当然是0.2μm的膜好一些,但是18KD的蛋白用0.45的膜也可以的。注意转膜时间不要太长。
现在使用的是0.45umNC膜
通过上面的实验方法,还是没有检测到蛋白的条带。请问是不是蛋白容易降解的话就不容易检测得到,或是需要通过什么特殊的方法处理蛋白。
还有蛋白的二级构象会不会对蛋白的检测产生影响。
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既然你的内参曝光后条带很好,应该降解的问题不是很明显的。裂解的时候可以加入蛋白酶抑制剂,如果不放心可以同时加几种蛋白酶抑制剂。
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bs4665[使用道具]
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你觉得还是western blot本身的技术问题了,不是蛋白的问题?
要是这样的话我就再多做几次了,虽然做了很多次了!
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