【求助】多维色谱蛋白质分析技术会取代双向电泳吗？

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标题:【求助】多维色谱蛋白质分析技术会取代双向电泳吗？

deducte[使用道具]
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发表于 2014-3-10 21:39 资料个人空间短消息加为好友

小中大

多维色谱蛋白质分析技术具有大规模分析，重复性好，可检查低丰富蛋白质的优点，那么，双向电泳技术还有存在的必要吗？

bluelake[使用道具]
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发表于 2014-3-10 21:40 资料个人空间短消息加为好友

小中大

2D是明日黄花，略去不谈
多维LC也不可能长足发展，二维色谱第二维直接上MS还好说，每一维分30个组份的收集的话，一个初始样品最终就是30个样要你分析，如过说是三维，这个数字是900，根本就不实用。并且重现性不好。

wood533[使用道具]
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发表于 2014-3-10 21:40 资料个人空间短消息加为好友

小中大

还是液体蛋白芯片好，就是用磁珠捕获蛋白，可以捕获低丰度的蛋白，是布鲁克最新研制的Clinprot技术，以后肯定取代2D胶了！呵呵
有兴趣的可以了解一下此技术，很是不错！

youyou99[使用道具]
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发表于 2014-3-10 21:40 资料个人空间短消息加为好友

小中大

前面几位多说了多维的好处，双向电泳确实有它自身的局限而且将逐渐淡出我们的视野，但是在目前的阶段还是有一定的作用的
1. 对初涉及蛋白质组学领域的实验室， 2D是他们开始认识蛋白质组的手段
2. 2D具有直观性，可以对你的蛋白质样本进行一个简单而又直观的展现
3. 与DIGE技术的结合，使双向电泳技术也拥有了内标，在做疾病蛋白质组学的差异分析和一些蛋白质修饰上具有液相系统不能达到的优势

wood533[使用道具]
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发表于 2014-3-10 21:41 资料个人空间短消息加为好友

小中大

楼上说的对极了，双向电泳还是有其优点的，一段时间内决不可能被取代！

chuntian1983[使用道具]
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发表于 2014-3-10 21:41 资料个人空间短消息加为好友

小中大

还是液体蛋白芯片好，就是用磁珠捕获蛋白，可以捕获低丰度的蛋白，是布鲁克最新研制的Clinprot技术，以后肯定取代2D胶了！呵呵
有兴趣的可以了解一下此技术，很是不错！

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所谓磁珠，就是SELDI的变种，取代2D完全无从说起，说实话个人对这种技术不是很看好，MALDI源不能和LC联用的特性决定了它更加适用于方法学研究，和简单样品。目前磁珠的种类很有限，并且特异性并不像他宣传的那么高，在BDAL没有推出clinprot概念的时候，这种磁珠就广泛存在了，当时主要是反相填料和磁体结合，用于净化样品。要真正从组学考虑的话，磁珠加上MALDI就基本没有任何优势。从clinprot的命名可以看出，这个概念是为蛋白质组学方法用于临床做铺垫的，要有明确的被检物，有特异性强的磁珠，才能有所发展。

wood533[使用道具]
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发表于 2014-3-10 21:42 资料个人空间短消息加为好友

小中大

楼上说的很对，任何一种方法都有他的缺陷。磁珠如果跟2D比起来，一是弥补了2D胶对低丰度蛋白不能检测的缺点，二是灵敏度准确率提高了，三是方法简单易行。还有很多，我不提了。磁珠的用途用于疾病的早期诊断，寻找生物标志物。每种方法都有他更适用的一个范畴，比如说血清，尿液等用CLinprot就很好。
不过我说取代2D胶，确实不太好，2D胶有他的优势，而且方法技术成熟，一段时间内不会被取代。
希望以后有更多的好技术层出不穷！

ending[使用道具]
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发表于 2014-3-10 21:42 资料个人空间短消息加为好友

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2D是明日黄花，略去不谈
多维LC也不可能长足发展，二维色谱第二维直接上MS还好说，每一维分30个组份的收集的话，一个初始样品最终就是30个样要你分析，如过说是三维，这个数字是900，根本就不实用。并且重现性不好。

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可是多维LC比较容易实现自动化，我觉着这才是多维LC的真正优势。
至于组分太多等问题，完全可以靠通量解决，当然由此引发的投资会使初期价格较高。
其实对比一下基因组研究就可以知道，分析检测的自动化是这种“组学”规模研究的关键。我认为多维色谱技术即便不能完全取代双向电泳，也会成为蛋白质组学研究的主要手段；而双向，将降格成辅助手段。
完全就事论事，欢迎各位站友指正。

wood533[使用道具]
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发表于 2014-3-10 21:43 资料个人空间短消息加为好友

小中大

QUOTE:

原帖由 ending 于 2014-3-10 21:42 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
2D是明日黄花，略去不谈
多维LC也不可能长足发展，二维色谱第二维直接上MS还好说，每一维分30个组份的收集的话，一个初始样品最终就是30个样要你分析，如过说是三维，这个数字是900，根本就不实用。并且重现性不好。

============ ...

呵呵，如果是从组学的表达谱的角度考虑，多维色谱也许还可以利用它相对的自动化程度高占得一席之地，但要说它的重现性高，就不敢认同了。并且三维以上的色谱实用性很差，做做方法学研究也就罢了。实际应用的没有几个人会那么做。
关键我们要搞清楚的是做蛋白质组学的目的。目前来说，蛋白质组学研究的主要目的并不是要说明这个样品里面一共都表达了什么蛋白，这个恐怕也搞不清楚，虽然现在还有一帮人在鼓吹表达谱的研究，但越来越多的人是把蛋白质组学作为了一个工具，研究蛋白质表达的相对定量才是根本所在，也是蛋白质组学的精髓所在。可以这么说，2DE和多维LC在这方面都是黔驴技穷了，不可能有长足的发展，多维LC都是骗经费骗文章的东西，很少能成功应用于真正的生物样品，特别是相对定量的。

ending[使用道具]
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发表于 2014-3-10 21:44 资料个人空间短消息加为好友

小中大

QUOTE:

原帖由 wood533 于 2014-3-10 21:43 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')

呵呵，如果是从组学的表达谱的角度考虑，多维色谱也许还可以利用它相对的自动化程度高占得一席之地，但要说它的重现性高，就不敢认同了。并且三维以上的色谱实用性很差，做做方法学研究也就罢了。实际应用的没有几个人会那么 ...

研究蛋白质表达的相对定量才是根本所在，也是蛋白质组学的精髓所在。
这条非常同意！要在蛋白质组的规模上进行研究的话，恐怕要寄希望于一些基础研究的突破了。