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标题:【求助】做免疫共沉淀选择什么样的表达体系?

ququer787[使用道具]
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【求助】做免疫共沉淀选择什么样的表达体系?


之前我是做了酵母双杂的筛选,现在打算用免疫共沉淀来继续验证两个蛋白的相互作用。
可是选择什么样的表达蛋白的体系呢?是酵母还是大肠杆菌?困惑中……
还请各位高手指点。谢谢了。
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is2011[使用道具]
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目前in vitro transcription/translation很常用,一定要细胞表达吗?
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IAM007[使用道具]
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可以进行in vitro CoIP来验证.
就是验证A和B的相互作用,
含A提取物+含B提取物,混合均匀后,用抗A-Bead拉下含A复合物,然后,将复合物进行SDS-PAGE,然后做抗B的IB.
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zhezhe[使用道具]
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我觉得可以用酵母表达出的蛋白作免疫共沉淀,比如clonetech的酵母双杂交试剂盒中的两个双杂交用的载体分别带了HA和c-Myc标签,因此可以把两个载体都转入一个酵母(也就是你筛出的那个阳性克隆),提酵母蛋白,然后先用-HA拽出来互作的蛋白复合体,电泳,转膜,再用抗c-Myc的抗体作western检测另一个蛋白的存在。
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kuaizige[使用道具]
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用酵母双杂的酵母菌株做免疫共沉淀似有不妥之处,如果能用其他系统表达蛋白再做免疫共沉淀会更有说服力,这样可以排除酵母细胞中的干扰因素,通常体外转录/翻译更常用,即用两个目的蛋白表达载体进行体外转录/翻译,然后免疫共沉淀,严格来说要用两个标签抗体分别“拽出来互作的蛋白复合体“,再用相对的标签抗体检测另一个蛋白的存在。
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kuaizige[使用道具]
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6
 
目前in vitro transcription/translation很常用,一定要细胞表达吗?

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这个in vitro transcription/translation具体是指什么?
如果用pET32a这个载体连上目的基因转入大肠杆菌中表达可行吗?
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wood533[使用道具]
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这个是我自己做完酵母双杂交以后作的免疫沉淀
2.2 实验方法:
2.2.1 免疫共沉淀:
1)  冰上混合下列反应体系于1.5mlEP管
*10ul 体外转录的诱饵蛋白
*10ul 体外转录的文库蛋白
2)  用枪头轻混,室温放置1h
3)  加入10ul(1ug)c-Myc单抗或者HA表位多抗,勿将二者加入同一反应体系中
4)  用枪头轻混,室温放置1h
5)  同时准备A蛋白滴:
a)  轻柔涡旋几次以混匀蛋白滴
b)  取足够体积的蛋白滴加入1.5mlEP管,用量取决于Co-IP反应体系(3ulProtein A /Each Co-IP)
c)  以PBS洗涤两次,方法如下:
Ⅰ加入200ulPBS到EP管
Ⅱ7000rpm,30sec
Ⅲ以枪头去上清
Ⅳ重复上述过程
Ⅴ最后用PBS重悬蛋白滴至初容积(5b步骤时的体积)
6)  向反应管中加入3ul蛋白A滴
7)  适当混合,室温下旋转1h
8)  7000rpm,10sec离心
9)  小心去上清,忌搅动蛋白滴
10)  用washbuffer1洗蛋白滴5次,方法如下:
a)  加200ul洗液入EP管
b)  颠倒或拍打混匀(通常建议不使用涡旋,但有时,涡旋可减少蛋白非特异性结合到蛋白滴上)
c)  7000rpm,10sec离心
d)  弃上清
e)  重复上述步骤4次
11)  用洗液2洗蛋白滴2次,300ul/次,按10 a-d步骤洗
12)  用20ulSDS-PAGE上样缓冲液重悬蛋白滴
2.2.2 电泳
1)  80℃加热5min,以洗脱和变性样品
2)  将EP管置于冰上,短暂离心,取10ul上样到SDS-PAGE minigel(推荐使用0.75mm厚的minigel系统,对于大于25KDa的蛋白采用8%-12%的聚丙烯酰胺凝胶,小于25KDa的蛋白采用≥15%的聚丙烯酰胺凝胶)
3)  电泳分离(具体同上)
2.2.3 检测
1)  将SDS-PAGE胶在干胶仪中干胶(条件和步骤同上)
2)  干胶后在磷屏中曝光过夜
3)  将曝光后的磷屏放入Typhoon4003仪器中扫描检测
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00无名指00[使用道具]
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这个in vitro transcription/translation具体是指什么?
如果用pET32a这个载体连上目的基因转入大肠杆菌中表达可行吗?

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很简单,因为你的目的基因前是T7启动子,直接将含相应基因的质粒(们)加入TNT Quick Coupled Transcription/Translation 反应中,可以两个基因分开转录翻译,也可以放到同一个反应中,然后用相应抗体coIP,另一个抗体鉴定是否相互作用蛋白也被“拽下来了”。
cuturl('http://www.promega.com/tbs/tm045/tm045.pdf')
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ququer787[使用道具]
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这个是我自己做完酵母双杂交以后作的免疫沉淀
2.2.3 检测
1)  将SDS-PAGE胶在干胶仪中干胶(条件和步骤同上)
2)  干胶后在磷屏中曝光过夜
3)  将曝光后的磷屏放入Typhoon4003仪器中扫描检测
......

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在您的实验中,目的蛋白是用同位素标记的吗?32P?还是其他?
如果采用二抗上连接HRP显影的方法也可以是吧。
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flower-201[使用道具]
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要看你的两个蛋白的来源了,如果来源哺乳动物的话,还是在培养的动物细胞里面最有说服力,因为免疫共沉淀很看重相互作用是否是在“生理条件下”发生的。用和目的蛋白来源的亲缘关系近的表达系统是最理想的。
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