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标题:【求助】包涵体复性的问题

莓菓333[使用道具]
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【求助】包涵体复性的问题


我做干扰素包涵体的复性试验,但是试了几个条件都不行。稀释复性每次总是会有很多沉淀,我的变性液是:
20mM PB+1mMEDTA+8M脲+0.1%β巯基乙醇,pH8.0
复性液:20mM PB+1mM EDTA+0.1M NaCl+0.2mM GSSG(氧化型谷胱甘肽)+0.5 mM GSH(还原型谷胱甘肽),pH8.0,可是结果仍然不好,请高手给与指点。
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3648755[使用道具]
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首先如果有其他选择的话,我不建议复性
虽然复性成功的例子很多,但是我还是建议首先尝试更换载体:
pet32a、PGEX、Pmal都有可能促进蛋白可溶,由包涵体表达变成可溶表达。
毕竟复性的条件很难摸索,成功的概率太小,浪费的时间也太多
如果一定复性请参考:
cuturl('http://refold.med.monash.edu.au/')
这个网站已经把目前所有文献中成功复性的例子统一归类了,并且将蛋白的序列、性质、复性的具体方法、发表的文献一一列举的非常清楚,所有想做复性的人,你是一定要参考的。
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ritou1985[使用道具]
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复性前对蛋白的性质一定要清楚,我随便列几个在下面,供您参考,
1. 蛋白预期的二级结构都是些什么。一般来说beta sheet占多数的蛋白较易复性,
2. 蛋白pI
3. 氨基酸组成,比如有没有cystine
4. 有没有底物?如果有结合的ligand之类,通常加入后会有所帮助,
5. 一般尿素中含有非常高的一种杂质(暂时记不起什么名字了,如果楼主一定要请回帖我再找找),当达到8 M的时候杂质的浓度也很大了。有的实验室会先纯化一下尿素,然后再溶解,有的直接先试GuHCl
6. 复性一般是梯度稀释,或者梯度透析,或者在柱上缓慢降低Urea,一下子降低太快(你的复性液)可能也是原因之一。
7. 盐浓度是否可以再高些?一般可以达到0.5 M,如果有更好的盐(如果这个蛋白的生化性质比较了解的话,应该再加入一些别的盐)
8. 一般会有Glycerol
9. 一般会有Arginine或者glycine
供参考!
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莓菓333[使用道具]
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包涵体PI为8.9,有5个二硫键,好像没有ligand,我做的变性用PB 缓冲的还不错,可是复性用PB 很不理想,Tris复性还有些效果,但也太好。
这边给的要求使用尿素变性的,请问,里面到底有什么杂质,很难除去吗?
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ritou1985[使用道具]
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偶也同意如果有其他方法不建议钻复性这个牛脚尖
复性只有对那些结构简单或者空间结构几何规则的成功纪律还大一点
有些蛋白你即使复性了,可溶了,但复性后的蛋白结构和天然的根本不一样,有些还是2聚体甚至多聚体
最近遇到的一个例子,两批BHK蛋白,虽然都可溶,但是一组来自天然可溶表达,一组来自复性表达,复性的那组空间结构变化,过同样孔径的超滤膜时,马上发生沉淀,原因就是超滤膜的孔径是相对近似球形分子而言的,结果不规则的就通不过。
你这个有5个2硫键的,复性形成聚体的几率大之又大!
还是做pET的可溶表达吧
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zsxan1990[使用道具]
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Resurrecting Abandoned Proteins with Pure Water: CD and NMR Studies
of Protein Fragments Solubilized in Salt-Free Water
Biophys J. 2006 Dec 1;91(11):4201-9. Epub 2006 Sep 15
再一次重复同一篇文章,比较适用于完全不可能溶解的蛋白,建议有空的时候可以读读。
对于LZ的蛋白有几点看法。
1。 既然有5个2硫键,那么0.1%β巯基乙醇 (15uM)是远远不够的,通常认为100mM的DTT才能完全打破2硫键,如果是β巯基乙醇,怎么也要2%吧。
2。 复性液 GSSG:GSH=2:5,这个比例需要再测量,建议梯度,从1:5 到1:20
3。 蛋白的复性浓度要很低,通常为1ml的蛋白加到100的复性液。
4。 用RP-HPLC作为复性的检测和分离的手段,通常需要3个小时到3天。
5。 蛋白是case by case,因此复性不了很正常,如果上述方法不行,建议找其他表达系统。
6。 5个2硫键是多了一点,见过3个成功的。
7。尿素里的杂质据说还是有一定影响的,我们通常用sigma的。
最后补充一点,蛋白复性以后,如果技术过关,还是可以得到具有正常结构的蛋白,在蛋白结构领域里有很多这样的例子。
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莓菓333[使用道具]
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谢谢楼上朋友的建议,我打算试一下,改变一下我的条件。
还有啊,我怎么找不到那本书呢,能不能告诉我在哪里才能找到啊。
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莓菓333[使用道具]
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8
 

还有上次我问朋友,他说5各二硫键,我查了一下是5个甲硫氨酸可能形成2对二硫键,这样的话巯基乙醇的量应该是多大范围啊
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lxh031[使用道具]
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那是期刊的文章,具体怎么找,建议去DXY的SOS求助里面问。
想破坏二硫键,一般都用2%巯基乙醇
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S6044[使用道具]
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Novagen等几个公司有复性缓冲液array试剂盒卖,有钱的话可以试一下。
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