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标题:【求助】有研究微管蛋白的筒子吗?请进来看看

viviwang1987[使用道具]
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【求助】有研究微管蛋白的筒子吗?请进来看看


有研究微管蛋白的战友吗,我有问题请教!!
beta-微管蛋白的结构是怎么样的啊,它有2B链吗?
我现在在研究蛋白质的一些东西,我们发现有一种蛋白质在疾病中是表达下降的,在genecards上的相关信息如下:
GeneCard for protein-coding TUBB2B GC06M003172
Aliases Descriptions External Ids
DKFZp566F223 Tubulin beta-2B chain HGNC: 30829
MGC8685 tubulin, beta 2B Entrez Gene: 347733
TUBB-PARALOG tubulin, beta polypeptide paralog UniProt: Q9BVA1
bA506K6.1 Ensembl: ENSG00000137285
这个蛋白是beta-微管蛋白的2B链吗,怎么我看的所有文献上面都没有提到beta-微管蛋白还有2B链啊!!??
请论坛里面的朋友多多帮助啊!!谢谢了先
这是genecards上面的说明


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这是expasy上的相关信息


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请大家多多帮忙啊,根据这些信息,我们找到的这个蛋白质到底是不是beta-微管蛋白的2B链啊??!!


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viviwang1987[使用道具]
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为什么分别用TUBB2B和beta-tubulin 2B chain在PUBMED里面搜索都没有找到相关文献啊(用beta-tubulin 2B chain搜索可以检索到2篇文献,但是都是不相干的文献),难道这个蛋白没有人研究过还是我的检索策略有问题,或者我根本就是理解错误了?!
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ero11[使用道具]
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NCBI上的gene信息
cuturl('http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=gene&cmd=Retrieve&dopt=Graphics&list_uids=347733')
pubmed上可能相关的8篇文献
cuturl('http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=gene&cmd=Link&LinkName=gene_pubmed&from_uid=347733')
google还是很有参考意义的,建议先google
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viviwang1987[使用道具]
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QUOTE:
原帖由 ero11 于 2014-3-29 09:03 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')

NCBI上的gene信息
cuturl('http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=gene&cmd=Retrieve&dopt=Graphics&list_uids=347733')
pubmed上可能相关的8篇文献
cuturl('http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=gene&cmd=Link&LinkN') ...

楼上斑竹给出的pubmed中的8篇文献中除开基因组相关的几篇文献之外,第三篇文献(A physical and functional map of the human TNF-alpha/NF-kappa B signal transduction pathway)我找到了全文,里面压根就没有TUBB2B什么事,只是有提到TUBB而以;而第八篇文献(Evolutionary history of a multigene family: an expressed human beta-tubulin gene and three processed pseudogenes)又没有全文,不知道具体内容如何,只是在摘要中没有提到TUBB2B。
所以说到底我还是不知道这个所谓的beta-微管蛋白2B链是什么概念,它跟beta-微管蛋白到底是什么关系,难道beta-微管蛋白真的分成2B链和其他单链吗,它的生物学功能又是什么?
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ero11[使用道具]
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cuturl('http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez')
查tubulin,限制在homo sapiens上,可以发现有许多类似蛋白:
TUBB、TUBB2B、TUBB2A、TUBA1A、TUBA1B、TUBA1C。。。。
TUB表示tubulin、A、B表示alpha、beta。。。至于后面的1A、2B之类的是否表示亚型?我也不是做这个的,不一定对,供参考!
至于8篇文献,好像有篇2003年Nature测序刚测出来的,可能是比较新的基因,还没有什么人做吧,先google吧,google有不少信息,查查再说
祝好运!
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greenbee[使用道具]
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首先, 我们看下你给出的那个TBB2B-HUMAN的分子量, 是50KD,
所以tubulin是单链的,没有你以为的有好多链,象肌球蛋白那样包括重链和轻链.
它就是单链形成的球状蛋白.
然后,我们看下Santa Cruz的抗体, tubulin有五种异构体: α, β, γ, δ, and ε.
其中光beta-tubulin也有五种异构体:
There are five β tubulin isoforms
(β-I, β-II, β-III, β-IVa and β-IVb) that are expressed in mammalian tissues.
β-I and β-IV are present throughout the cytosol, β-II is present in the nuclei
and nucleoplasm, and β-III is a neuron-specific cytoskeletal protein.
最后,我们来看下gene库,里面有beta 1;beta2A,2B; beta 4;beta 5等, 编码它们的mRNA也是不一样的.
这不难理解啊,异构体在post-translational水平上形成的.
也许你会问, 为什么前面是β-I, β-II, β-III, β-IVa and β-IVb, 后面叫beta 1;beta2A,2B; beta 4;beta 5?
这个你的好好去基因库查查,可能叫法不同而已.
可以得出结论, 正如small版所说, 后面的1A、2B之类的表示亚型, 不是你所认为的蛋白其中的某一条链.
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viviwang1987[使用道具]
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多谢各位的帮助了,看来它可能是beta-微管蛋白的亚型吧
我再继续查查,要是有不懂得继续向各位请教:) 
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