蛋白质与蛋白组学

我在stucture analysis选项里Molprobity ramachandran plot点开了一个结果，有些类似地形的图，下面有这种注释：
There were 9 outliers (phi, psi):
A 9 GLY (-134.9, 93.2)
A 17 LYS (-61.1, 14.0)
这是什么意思呀？帮忙看一下17lys是说有17个lys麽？-61.1是什么意思？14.0又是什么意思？感谢........
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那个“地形图”是 Ramachandran plots 。stucture analysis 里的 Ramachandran plots 用来表示该蛋白质内所有氨基酸残基的二面角。
Ca 联结的两个键是单键。 Ca-Nn , Ca-Cn+1 , Ca-Nn 旋转角度为 Phi ，Ca-Cn+1 旋转角度为 Psi ，看上去似乎 Phi Psi 可以为任何角度（-180-180），但由于一些原因，Phi Psi 是有限制的。
There were 9 outliers (phi, psi) 表示的意思可能是 有9个残基的 Phi Psi 处于不合理状态。A 9 GLY (-134.9, 93.2) 表示 A 链第9个氨基酸残基 （Gly) 的Phi Psi 是 (-134.9, 93.2) 。
氨基酸的Phi Psi 不合理既有可能是蛋白质本身构象的影响，也可能是由于测量，计算等原因造成。

PyMol , coot, Cn3D这三个软件在哪里下？免费的麽？在PDB网站不能直接看麽？

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网上应该可以找到免费下载用于 windows 的版本，PDB网站不能直接看。