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标题:【求助】Tricine-SDS-PAGE跑到一半时,溴酚兰变黄!

89tongzijun[使用道具]
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【求助】Tricine-SDS-PAGE跑到一半时,溴酚兰变黄!


各位前辈,最近这两次Tricine-SDS-PAGE都在跑到一半时发现前沿溴酚兰变成黄色,而且是从中间位置响两边扩散,分析原因可能是pH降低,可为什么会降低呢?或者还是有别的原因?请各位指点~
负极缓冲液:0.1M Tris, 0.1M Tricine,0.1% SDS,pH8.25(pH文献上说不用调,按照配方配就应该是,我照做了,也没测pH)
正极缓冲液:0.2M Tris, pH8.9(HCl调的)
凝胶缓冲液:3M Tris, 0.3% SDS,pH8.45(HCl调的)
还有一个问题,Tricine-SDS-PAGE 分离胶16.5%到底要跑多久?应该用什么条件跑?恒流还是恒压?多少?我跑的电泳溴酚兰一直都没有跑到底部,因为跑到胶的中部就已经8个小时了
请各位前辈给我指点,非常感谢!
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溴芬兰的ph值 发生变化了,不影响结果
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is2011[使用道具]
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Tricine-SDS-PAGE ,20mA恒流,2.5小时,就可以了。
你最好用预染marker,这样分离的怎么样,可以实时检测。
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89tongzijun[使用道具]
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可是我用30mA怎么2.5h时只刚刚进入分离胶呢?
下面是我的配方。麻烦有经验的前辈帮我分析一下。
Separating gel monomer (49.5% T 6% C)
Stacking gel monomer (49.5% T 3% C)
Anode buffer (0.2 M Tris, pH 8.9)
Cathode buffer (0.1 M Tris, 0.1 M tricine, 0.1% SDS, pH 8.25)
It is not necessary to adjust the pH of this buffer, which should be around 8.25. (这个我没调,也没测pH,不知道这样做对不对)
Gel buffer (3.0 M Tris, 0.3% SDS, pH 8.45)
Stacking gel (4.0% T 3.0% C)
In a 50-ml conical tube, mix 0.8 ml of the stacking gel monomer, 2.5 ml of the gel buffer, and 6.7 ml dH2O. Degas under vacuum 10 to 15 minutes. Add 50 µl of 10% ammonium persulfate and 10 µl TEMED. Swirl gently to mix. Use immediately. Produces 10 ml of stacking gel, sufficient for four minigels.
Separating gel (16.5% T 6.0% C)
In a 50-ml conical tube, mix 10.0 ml of the separating gel monomer, 10.0 ml of the gel buffer, 3.1 ml glycerol, and 6.9 ml dH2O. Degas under vacuum 10 to 15 minutes. Add 100 µl of 10% ammonium persulfate and 20 µl TEMED. Swirl gently to mix. Use immediately. Produces 30 ml of separating gel, sufficient for four minigels.
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89tongzijun[使用道具]
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QUOTE:
原帖由 is2011 于 2014-3-29 16:55 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')

Tricine-SDS-PAGE ,20mA恒流,2.5小时,就可以了。
你最好用预染marker,这样分离的怎么样,可以实时检测。

打扰了,请问Tricine-SDS-PAGE,恒流20mA,我怎么8个小时只跑到胶中部呢?您能把您的配方告诉我吗?或者我在帖子里发了我的配方,请您看看哪里有问题,谢谢!
根据另一位战友的建议,我用SDS-PAGE跑了一次,分离胶15%,浓缩胶5%,大概在两个半小时溴芬兰跑到下面,从时间上看尚可,可是小分子肽(7kDa)看不清,应该是分辨率低的原因吧?能否再提高分离胶的浓度,然后还用普通SDS-PAGE跑呢?
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is2011[使用道具]
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根据另一位战友的建议,我用SDS-PAGE跑了一次,分离胶15%,浓缩胶5%,大概在两个半小时溴芬兰跑到下面,从时间上看尚可,可是小分子肽(7kDa)看不清,应该是分辨率低的原因吧?能否再提高分离胶的浓度,然后还用普通SDS-PAGE跑呢?
分离胶15%,跑7kDa的东西是看不到的。这么小的蛋白还是只能用tricine-sds-page
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我今天跑普通SDS-PAGE时,也出现了溴酚兰变黄的情况。正在染色,还不知道会不会有影响呢
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我今天跑普通SDS-PAGE时,也出现了溴酚兰变黄的情况。正在染色,还不知道会不会有影响呢
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QUOTE:
原帖由 is2011 于 2014-3-29 16:56 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')

根据另一位战友的建议,我用SDS-PAGE跑了一次,分离胶15%,浓缩胶5%,大概在两个半小时溴芬兰跑到下面,从时间上看尚可,可是小分子肽(7kDa)看不清,应该是分辨率低的原因吧?能否再提高分离胶的浓度,然后还用普通SDS-PAGE跑呢?
分离胶1 ...

分离胶15%,跑7kDa的东西是看不到的。这么小的蛋白还是只能用tricine-sds-page
我的确首先考虑Tricine-SDS-PAGE,可是一直跑不动的感觉,2.5h只刚刚出浓缩胶。
这个电泳已经快把我折磨死了!!!
希望战友能够给我一个全面具体的protocol,非常非常非常感谢~
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89tongzijun[使用道具]
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QUOTE:
原帖由 DONT 于 2014-3-29 17:08 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')

我今天跑普通SDS-PAGE时,也出现了溴酚兰变黄的情况。正在染色,还不知道会不会有影响呢

应该没有太大的影响,可能是电泳缓冲液出了问题,pH降低了,但是条带看上去没什么异常。
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