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标题:【求助】2d电泳结果图分析

fqswdzd[使用道具]
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【求助】2d电泳结果图分析


求助:样经过pbs和纯水洗过3遍,跑电泳前用蛋白酶抑制剂和DNA及RNA酶处理过,第一向等点聚焦升压均没问题,第二向跑衡流,起始电流10mA,待溴芬兰成线,提升到30mA,最后结束电压434V,过程中用4度循环水浴冷却,
结果存在两个问题:横向上 横条纹太多太重,不知道该怎么去处
纵向上:蛋白没有分离成圆点,大部分呈雨滴状,请哪位2d高手解释下原因及改进方法,不胜感激


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2014-4-5 11:27
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QUOTE:
原帖由 fqswdzd 于 2014-4-5 11:27 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')

求助:样经过pbs和纯水洗过3遍,跑电泳前用蛋白酶抑制剂和DNA及RNA酶处理过,第一向等点聚焦升压均没问题,第二向跑衡流,起始电流10mA,待溴芬兰成线,提升到30mA,最后结束电压434V,过程中用4度循环水浴冷却,
结果存在两个问题:横向上 横条纹太多太重, ...

我认为是上样量太多所致。
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上样量多会引起雨点么?我上了900ng的样,应该不多吧?再少了很多点都看不清了
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vvmmoy[使用道具]
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你可以看一下amersham 的手册。900ng?我不信,不到1ug,用考染能染成这样?恐怕银染也染不出来吧,单位对吗?蛋白浓度测试的准吗?
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fqswdzd[使用道具]
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回复 #4 vvmmoy 的帖子

哦不好意思单位写错了,是900ug,蛋白浓度误差不会太多,最多上样量1mg,跑了2次了都这样
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vvmmoy[使用道具]
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你可以用500ug 试试,900我认为也多。要不可以用700
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补充说一下,我用的是PH3-10胶条,是不是用PH4-7效果好些?
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vvmmoy[使用道具]
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你的酸性蛋白是很多,可以考虑用PH4-7。
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fqswdzd[使用道具]
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这是这周又跑的结果,这张是3-10的胶,上样650ug,明显已经有很多点看不见了,样品用pbs和纯水各洗了4遍,,但是还是横向拖尾严重....
更头疼得是纵向的胶还是都聚成了雨点状,为什么不是圆点,起始电流20ma 2块胶,待溴粉蓝成线60ma 2块胶,5个半小时结束电泳,sds,tris,丙酰胺,AP都现配的,用的伯乐的槽,谁能告诉我为什么啊?


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fqswdzd[使用道具]
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这张是4-7的,上样750ug,效果也不好,还是横纹
然后纵向是雨点,疯了...........


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