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我想您应该先确定几个问题:
1、您的酶切是否完全,我指的是PCR产物,PCR引物添加了多少的保护性碱基,应该使用什么样的酶切BUFFER?因为相对来说比较难从胶上辨别是否酶切。所以我一般在做了1-2次PCR产物酶切连接不成功后,就会先将PCR产物连入T载体,然后再酶切,这样的效果一般很好。
2、感受态细胞的效价有没有问题,应该做完以后做一次转化检测效价。
3、连接完以后,如果您自己认为您做转化的信心不是很高,可以先转化DH5a,因为它的转化效率一般比BL21高上10倍,您可以培养提纯后,再转BL21这样您就可以有很多的载体做试验了,不用天天再重复酶切和连接。
但无论如何还是要设置好对照,对照做好了,解决问题 的速度就更快,排除疑问的速度也快,不过可能相应的工作量就大。看您自己的想法了?
好运!