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这种PEG的影响应该可以忽略不计的,浓缩时用到的PEG都是未经活化的,仅仅起到吸水的作用,并不会与蛋白质发生反应,它与我们做蛋白修饰时常用的PEG不是一个概念,用于修饰的PEG的末端羟基都被取代(活化)成活性基团以后才会与蛋白的氨基、巯基等发生反应。楼主的蛋白并没有与PEG偶联,而且跑电泳时取样也很小,所以它对目的蛋白的电泳的影响可以忽略。即便是偶联上PEG的蛋白质也可以跑SDS-PAGE电泳,只是条带有些弥散、分子量有些偏差而已,但这也常作为PEG修饰后偶联度的一个测量方法,简单快速就是误差比较大。