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标题:【求助】磷酸化WB做不出来,怎么办?

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【求助】磷酸化WB做不出来,怎么办?


我做的磷酸化WB步骤如下:
1、提取细胞总蛋白
细胞裂解液配方如下:
Tris-HCl 50mmol (pH7.5)
NP-40 1ml
TritonX-100 1ml
SDS 0.1g
NaCl 150mmol
EDTA 2mmol
EGTA 1mmol
D4H2O 定容至100ml
临用时加入1 mmol/L NaF ,1 mmol/L Na3VO4,protease inhibitor cocktail (Roche).
胰酶消化收集细胞(不知道胰酶对磷酸化有无影响),每10×6个细胞加100μl细胞裂解液,超声破碎,3×15秒,12000rpm,4°c,10min,收集上清。
所有操作都在冰上进行,且快。
蛋白定量用Bradford Assay,测出浓度为4.24mg/ml
用5×上样缓冲液稀释成3ug/ul,100°c,5min煮沸
2、电泳,转膜
蛋白上样15-20μl,8%的分离胶,95v,15min,5%的浓缩胶,165v,75min
有预染marker
转膜 : 恒流 400mA,90min。
预染marker全部转上去了。
3、封闭,一抗,二抗
5%脱脂奶粉,37°c,2小时
TBST洗膜,10min,3次
一抗为santa cruz的p-tyr(PY20),TBST/1%脱脂奶粉配制,1:1000,4°c过夜,TBST洗膜,10min,3次
二抗为pierce的羊抗鼠,TBST/1%脱脂奶粉配制,1:2000,37°c,2小时,
TBST洗膜,10min,3次
4,显影,压片
ECL(pierce,A液B液1:1)4-5min,曝光3 min,显影3-5分钟,压片2小时
没有任何条带,连非特异性条带都没有。
同一组蛋白做其他抗体,条带非常清楚。
不知道什么原因,郁闷中,磷酸化真的象传说中那么难吗?请各位高手出手分析一下,不甚感激!!!
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guagua[使用道具]
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同一组蛋白做其他抗体,条带非常清楚。

=========================================================================================

那是否说明是抗体的问题呢?能否检测一下抗体(尤其是一抗)有没有问题?
比如有没有阳性对照可以试一下,或者干脆做点杂交,把一抗点到膜上,封闭、二抗、显影。。。
如果能出来说明抗体本身没问题,但是抗体不与目的蛋白结合(看看说明书是否适用于该实验)或者没有目的蛋白
如果也出不来就是一抗的问题
没做过磷酸化WB,仅供参考!
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回复 #2 guagua 的帖子

抗体是santa新买的,应该问题不大。
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lz应该是新手吧
没做过磷酸化的蛋白
但是有一点是肯定的
那就是涉及磷酸化的蛋白做WB千万别用脱脂奶粉
建议改用BSA!
原因还是自己去查资料吧
这样会记得很牢的
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3648755[使用道具]
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之前没做过磷酸化,我也查过BSA,也已经买了,还没用,不知道用多大浓度,说2%3%5%的都有。这个我会尝试的。
楼上的大虾,我的步骤还有什么问题吗?请多批评啊!
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ha111[使用道具]
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磷酸化蛋白WB和非磷酸化的一样,并没有什么特别的,考虑以下方面:
1.1 mmol/L Na3VO4配制有没有问题,Na3VO4是磷酸化酶抑制剂,其配置有一实的特点,Homemade phosphatase inhibitor cocktail
Sodium orthovanadate activation:
• in 20 ml lysis buffer add 100 μl of 200 mM stock of sodium orthovanadate activation and final concentration is 1 mM
• 200 mM Sodium orthovanadate activation stock (MW 183.9)
o 0.37 g into 10 ml H2O
o adjust pH to 10 (solution becomes yellow)
o boil solution until it turns colorless (~10 min)
o cool to R.T.
o readjust pH to 10.
o repeat steps 3, 4 and 5 until solution remains colorless and pH stabilizes at pH 10 PRC CORE Page 4 of 9 LAB
o store activated orthovanadate as aliquot at -20°C (300 μL in each aliquot)
如果不按上面的方案来进行,则没有将其激活,那么他是不具备酶活性的,这样你的磷酸化蛋白很快就被去磷酸化,当然检测不到。
2.可能抗体浓度不合适,不然怎么连非特异条带都没有,顺便问一下,有没有泳道。如果没有,很可能操作或抗体有问题。
3.目的蛋白分子量是多大的,400mA会不会把蛋白转过
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nn255[使用道具]
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1、你在做细胞裂解之前二个小时,加入钒酸钠,目的是抑制磷酸化酶的作用。
2、超声是不是起作用,我感觉没有必要,因为你的细胞裂解液中含有NP40。
3、在加入的loading buffer及转膜过程中要加入钒酸钠
这是我个人与你不同的地方
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我磷酸酶抑制剂的配制可能不正确!
在显影压片后,我把膜用考马斯亮蓝染色观察,发现上面有条带,非常清楚。
做普通的WB,400mA转,预染marker非常漂亮。
也感谢sdjlmu 的建议,我在提蛋白的时候就是一直在考虑,也尝试过,胰酶消化或者细胞刮收集细胞,超声破碎到底有无差异,不超声破碎的话在冰上裂解多久才合适呢?你能说说你提蛋白的步骤吗?不甚感激!
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baidukk[使用道具]
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真的用脱脂奶粉会有那么大的影响吗?我的师兄以前就用脱脂奶粉做出来过的,不过现在做不出来了......
我们会试试换BSA 呵呵
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HPLC使者[使用道具]
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我在提蛋白的时候就是一直在考虑,也尝试过,胰酶消化或者细胞刮收集细胞,超声破碎到底有无差异,不超声破碎的话在冰上裂解多久才合适呢?你能说说你提蛋白的步骤吗?不甚感激!
这主要是我们实验室的一般的提取蛋白方法:
1、用刮子收集细胞(当然在做磷酸化的时候,要提前加钒酸钠)到15mL离心管中
2、1000g离心3分钟,用PBS洗一次,1500g离心2分钟,弃PBS,加入1mLPBS悬浮到ependorf管中,1500g离心2分钟,真空吸净液体
3、加入细胞裂解液(先用先加钒酸钠)冰浴18分钟(不固定,20分钟也可),然后高速离心取上清就可以了
在我们室检测磷酸化是很普通的实验,很容易做出的
另外,之所以不用脱脂奶粉,是因为奶粉中的一些特殊物质,导致在显影时背景增高,所以用3%到5%的BSA均是可以的
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