蛋白质与蛋白组学 » 讨论区 » 经验共享 » 【求助】对磷酸化的蛋白做western和普通蛋白有什么区别

采购询价

点击提交代表您同意 《用户服务协议》 《隐私政策》

 
需要登录并加入本群才可以回复和发新贴

标题:【求助】对磷酸化的蛋白做western和普通蛋白有什么区别

wanglaoshi[使用道具]
三级
Rank: 3Rank: 3


UID 77295
精华 0
积分 449
帖子 597
信誉分 100
可用分 3796
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-11-15
状态 离线
1
 

【求助】对磷酸化的蛋白做western和普通蛋白有什么区别

请教大家,对磷酸化的蛋白与对普通蛋白做western 有什么区别,需要注意些什么?多谢.
顶部
baidukk[使用道具]
四级
Rank: 4


UID 77444
精华 0
积分 803
帖子 1226
信誉分 100
可用分 7048
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-11-17
状态 离线
2
 

有人说,要在loading buffer和转移buffer中加入磷酸酶抑制剂Na3VO4,可有人说没加也做出来了。我觉的应该这不是关键问题,所以没加。但遗憾的是,前不久做的western,最后b-actin显色挺好的,但我的磷酸化目的蛋白一点都不没有。当然可能其他方面都可能存在问题:1.目的蛋白的上样量如何?(磷酸化蛋白容易脱磷酸化,所以提取蛋白时很重要,而且本身磷酸化蛋白的丰度就低);2抗体的浓度可能要高;3显色可能要敏感;4洗膜时间要短点,次数少点,且摇的力度要小点;
这是我的个人看法,还希望多交流
顶部
tie8[使用道具]
三级
Rank: 3Rank: 3


UID 75844
精华 0
积分 442
帖子 543
信誉分 100
可用分 3571
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-10-28
状态 离线
3
 
蛋白的磷酸化是一个非常迅速的反应,所以取样品的过程要迅速,样品要新鲜,样品处理最好在冰上操作,操作时间尽量短还有就是最好是新鲜配制的裂解液,裂解液中一定要有蛋白酶抑制剂和磷酸酶抑制剂,okadaic acid, NaF是磷酸酶抑制剂。再者,还要看 你检测的蛋白磷酸化位点是什么氨基酸,如果是酪氨酸还要加1um的sodium vanidate 即原钒酸钠 ,上样前不要煮沸,煮沸可能会破环其磷酸化位点。
封闭采用专用脱脂奶粉(经过特别工艺去除脂肪,并灭活蛋白激酶和蛋白磷酸酶的活性,蛋白激酶的灭活有利于保护野生型蛋白底物处于非磷酸化状态;灭活蛋白磷酸酶可使已磷酸化蛋白免于去磷酸酶的去磷酸化,因而能维护蛋白的磷酸化状态,为Western Blot提供最佳封闭效果的同时不影响蛋白底物的性质。)
其余的和一般的western差不多了,注意的是一抗需要是针对专门的磷酸化抗体的,二抗没有什么特殊说明
顶部
hold住[使用道具]
四级
Rank: 4


UID 75093
精华 0
积分 566
帖子 832
信誉分 100
可用分 4962
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-10-19
状态 离线
4
 
请问okadaic acid, NaF需要多大浓度啊?还有为什么不能煮沸呢?还有好像不能用奶粉封闭吧?非特异性条带会很多,因为它本身也会有磷酸化条带啊。
顶部
eric930[使用道具]
四级
Rank: 4


UID 79368
精华 0
积分 722
帖子 1061
信誉分 101
可用分 6148
专家分 10
阅读权限 255
注册 2011-12-10
状态 离线
5
 
tie8所说“磷酸化蛋白上样前不能煮沸”,对吗?那蛋白的三维结构如何打开?抗体如何识别抗原表位呢?
到底磷酸化蛋白上样前要不要煮沸?
顶部
hold住[使用道具]
四级
Rank: 4


UID 75093
精华 0
积分 566
帖子 832
信誉分 100
可用分 4962
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-10-19
状态 离线
6
 

我煮过,也有条带,就是不知道是不是不煮会更好?
顶部
bling[使用道具]
三级
Rank: 3Rank: 3


UID 77268
精华 0
积分 383
帖子 486
信誉分 100
可用分 3216
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-11-15
状态 离线
7
 

我这有一个关于磷酸化抗体的推荐步骤:其中讲到最好不要煮。
1. Perform SDS-polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PAGE) on either a bovine
cardiac preparation prepared as described in the technical note below or an
experimental sample; transfer the proteins to nitrocellulose. Do not boil
preparation. Warm to 37°C for 30-45 minutes before loading the sample.
2. Wash the blotted nitrocellulose twice with water.
3. Block the blotted nitrocellulose in freshly prepared TBS containing 5% nonfat dry milk and 0.05% Tween 20 (TBST-MLK) for 20 minutes at room temperature with constant agitation.
4. Incubate the nitrocellulose with 0.5-2μg/ml of anti-phospho-Phospholamban
(Ser16), diluted in freshly prepared TBS-MLK overnight with agitation at 4°C.
5. Wash the nitrocellulose twice with water.
6. Incubate the nitrocellulose in the secondary reagent of choice (a goat anti-rabbit HRP conjugated IgG, Catalog # 12-348, 1:5000 dilution was used) in TBS-MLK for 1.5 hours at room temperature with agitation.
7. Wash the nitrocellulose twice with water.
8. Wash the nitrocellulose in TBS-0.05% Tween 20 for 10 minutes.
9. Rinse the nitrocellulose in 4-5 changes of water.
10. Use detection method of choice (enhanced chemiluminescence was used).
顶部
vera+[使用道具]
四级
Rank: 4


UID 76438
精华 0
积分 506
帖子 711
信誉分 100
可用分 4361
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-11-5
状态 离线
8
 
顺便想问一下,该文章的来源以及您自己实际也是这么做的么?结果咋样?
顶部
bling[使用道具]
三级
Rank: 3Rank: 3


UID 77268
精华 0
积分 383
帖子 486
信誉分 100
可用分 3216
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-11-15
状态 离线
9
 

文章是我买一抗附带说明书上的,我样品处理是按照他们要求的,其余步骤我是按照我们实验室常规做法,结果很稳定阿。
顶部
vera+[使用道具]
四级
Rank: 4


UID 76438
精华 0
积分 506
帖子 711
信誉分 100
可用分 4361
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-11-5
状态 离线
10
 

所有磷酸化蛋白都是不煮沸吗?我的目的蛋白是pSTAT3
顶部