【求助】SELDI的缺点都有那些？

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标题:【求助】SELDI的缺点都有那些？

ilovegaga[使用道具]
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发表于 2014-5-16 10:48 资料个人空间短消息加为好友

小中大

SELDI的缺点都有那些？
朋友们讨论一下，讲的全面具体一点，最好列出参考文献，而不是自己的主观判断。
谢谢各位！

qianqin1977[使用道具]
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发表于 2014-5-16 10:48 资料个人空间短消息加为好友

小中大

这个东东IKWW2和上帝没有手老兄懂得很多,不知道他们什么时候上来.

ilovegaga[使用道具]
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发表于 2014-5-16 10:49 资料个人空间短消息加为好友

小中大

先说说自己知道一点的东西，
1、对于不同的样本，根据检测的目标采取或者设计几种芯片，理论上可以把所有的相同性质蛋白质捕获，但是实际上仍有少量的分子没与表面探针结合。
2、使用SELDI-TOF-MS，仅能给出蛋白质的分子量，不能给出C端、N端的序列，也没法知道蛋白质的构型，因此需要将蛋白质充分纯化后，用蛋白酶消化芯片上的蛋白质，分析肽段，再用生物信息学方法鉴定蛋白质序列。
3、在国内，该芯片费用较高，分析质谱需要大量后续工作支持。
4、比较适合临床诊断，对于蛋白质的鉴定，和进一步功能研究不是非常支持。

nn255[使用道具]
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发表于 2014-5-16 10:49 资料个人空间短消息加为好友

小中大

SELDI飞行时间质谱是一种比较新的蛋白鉴定技术和方法。它最吸引人的地方是它将样品的分离和质谱（准确的说是色谱）鉴定蛋白联用，使得样品在不用粗分离的状态下直接上样，这使得多蛋白样品（如血清）能够快速的得到鉴定；同时，它的上样量是纳克级。故而SELDI－TOF质谱可用于快速分析差异表达和微量制备目的蛋白。加上其所用芯片具有多种类型，所以该仪器还可用于化学样品的分离和鉴定。
如楼上朋友所说，SELDI技术并没有将蛋白质末端逐步降解，所以它和传统意义上的飞行时间质谱仪有较大差别，但是这种技术上累加的产品应该不会太久就会面世，所以现如今的仪器准确的说是一种色谱。它的芯片与样品所采用的也是非可逆的结合方式，所以一旦使用过后不能回收利用，这也同时增加了它的使用成本。
值得一提的是它的价格，包括所有配套设备和配送芯片一共可能要45万美元。这个价格一般的实验室是不能承受的，中心实验室和共享实验室可以考虑。

ztonyc[使用道具]
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发表于 2014-5-16 10:49 资料个人空间短消息加为好友

小中大

相关疾病：
艾滋病
就我知道的说两句：
楼上说得很对，SELDI－TOF 主要应用于建立临床诊断模式，下面仅提供一些重要文献：
use of proteomics patterns in serum to identify owarian cancer
这项工作很有意义，发表在the lancet，2002，vol 359：572
另一项有趣的工作是艾滋病鸡尾酒疗法发明人DAVID D.HO 应用这一技术发现了有关anti－HIV-1的蛋白，文献如下：
SCIENCE 2002 VOL 298:995
但是我个人认为SELDI－TOF 在蛋白鉴定方面存在一些不足，不如MALDI-TOF.
还有如果想知道样品中蛋白的总体情况，必须用不同的芯片，这样耗费就会比较大。
SELDI -TOF 最大的优点是速度快呀！快速筛选的首选工具！

moonlight45[使用道具]
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发表于 2014-5-16 10:50 资料个人空间短消息加为好友

小中大

3年前总结的是，用SELDI发现了有意义的结果，就采用该芯片使用的方法来分离，然后鉴定。就是利用其芯片的快速、高通量。但目前没有任何一种分离（SELDI芯片）能保持“所有”蛋白质不丢失的。
SELDI后面的质谱能鉴定不？样本消化后成多肽才能MALDI鉴定，但现在SELDI一般并不消化样本。不能鉴定是瓶颈。
其他，谢谢楼上各位的高见，坚决同意。
文献一篇：CURRENT DEVELOPMENTS IN SELDI AFFINITY TECHNOLOGY, Mass Spectrometry Reviews, 2004, 23, 34–44

pengke1983[使用道具]
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发表于 2014-5-16 10:51 资料个人空间短消息加为好友

小中大

从实践感觉最好将SELDI的板处理技术，他的分析软件与MALDI-TOF-TOF结合使用，那最好。其实，那只蜻蜓公司就是这个可以表面层析的板最好。

PINK[使用道具]
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发表于 2014-5-16 10:51 资料个人空间短消息加为好友

小中大

今天看到这里，就顺便说几句。
据我所知，SELDI最大的缺点是：重复性不好。不同的样品处理方法，不同的操作规程，不同的仪器，所得出的结果都有差异。
SELDI是一种很好的蛋白质分离技术，它的独特性在于它的芯片技术。它捕获的是在一定分子量范围内的具有一种特性的蛋白/肽分子。对于血清蛋白分子来说，他捕获到的只是很少量的蛋白。

guagua[使用道具]
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发表于 2014-5-16 10:51 资料个人空间短消息加为好友

小中大

SELDI是一种很好的蛋白质分离技术，它的独特性在于它的芯片技术。这是她的技术的整个优点所在，由此带来了可以将分离检测分析一体化，从而快速简便的优点。SELDI的缺点在于她的重复性，这个缺点的产生在于厂家制造质谱仪非其所长，使得虎头－SELDI芯片，加上了一条蛇尾－－不过关的质谱仪，因此产生了hsyl和yezi0623 所讲的问题，二位都是高手。个人认为要解决她的缺点，厂家必须和质谱仪的大腕厂家合作，共同生产。

qiangren789[使用道具]
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发表于 2014-5-16 10:52 资料个人空间短消息加为好友

小中大

QUOTE:

原帖由 guagua 于 2014-5-16 10:51 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
SELDI是一种很好的蛋白质分离技术，它的独特性在于它的芯片技术。这是她的技术的整个优点所在，由此带来了可以将分离检测分析一体化，从而快速简便的优点。SELDI的缺点在于她的重复性，这个缺点的产生在于厂家制造质谱仪非其 ...

也就是说把seldi的芯片和ESI-MS或MALDI甚至FT-ICR偶联,强强联合?

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