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标题:【求助】我的小分子蛋白电泳出了问题

queen[使用道具]
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【求助】我的小分子蛋白电泳出了问题


我的目的蛋白为8kd,之前分别跑过15%、20%的普通sds-page,ECL显色后都未出现目的条带,后来在园子里学到小分子蛋白应该跑tricine电泳,于是找来配方,是论坛里找的,也看了看一些中外文的文献,感觉配方可以并稍做改动试做了两次,因为是尝试,所以只做到电泳,然后考马斯亮蓝染色,没有往下进行转膜,想先看看考染结果,有些把握再向下做。可两次考马斯染色脱色后都是14kd以下什么都看不到,做过的前辈能不能帮我分析一下,不胜感激!现附图如下:


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2014-5-24 14:18
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queen[使用道具]
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再补充些:气泡上面是间隙胶,气泡下面是分离胶
一. 电泳的配方如下:1. Low Bis acrylamide(49.5% T, 3% C)
Acylamide 48.0g
Bis 1.5g
Water make up to 100ml
2. High Bis acrylamide (49.5% T, 6% C)
Acrylamide 46.5g
Bis 3.0g
Water make up to100ml
3. Gel Buffer (2M Tris/cl, PH8.45, 0.3% SDS)
SDS 0.1g
Tris 12.1g
Water make up to 50ml
PH to 8.45 with HCL
4. Anode (Lower) buffer 阳极缓冲液 (0.2M Tris/cl, PH8.9)
Tris 12.11g
Water make up to 500ml
PH to 8.9 with HCL
5. Cathode (Upper) buffer 阴极缓冲液 (0.1M Tris/cl, 0.1M Tricine, 0.1% SDS, PH 8.25)
Tris 6.06g
Tricine 8.96g
SDS 0.5g
Water make up to 500ml
二、 胶的配制
1. 16.5% T 6% C separating gel 3ml
49.5% T 6% C 1ml
Gel buffer 1ml
Glycerol 0.64ml
Water 0.36ml
10%AP 0.01ml
TEMED 0.001ml
2. 10% T 3% C spacer gel 1ml
49.5% T 3% C 0.21ml
Gel buffer 0.33ml
Water 0.46ml
10%AP 0.0033ml
TEMED 0.0003ml
3. 4% T 3% C stacking gel 1.25ml
49.5% T 3% C 0.1ml
Gel buffer 0.31ml
Water 0.84ml
10%AP 0.01ml
TEMED 0.001ml
三. 上样缓冲液用的还是跑普通sds-page的,5×的,因为之前把蛋白一次变性了,所以没有重新配,以前看园子里有人问过,记得说这样不会影响的。有一点得交待,蛋白抽完后测浓度是12umol/ul,上样10ul(2ul缓冲液)。
四. 电泳时30v 1h,进入分离胶后调为100v,溴芬兰离底线1.5cm处停止电泳,50%乙醇+10%乙酸固定20分钟后考染40分钟,脱色40分钟。
带彩线的marker最底下一条分子量应为10kd,电泳过程中没有看到,现在胶上最后一条应该是15kd的,不带彩线的marker最底下一条为14点多,胶上能看到。以下就什么都没有了:( 请学长们帮忙分析,感激涕零!!
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hold住[使用道具]
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QUOTE:
原帖由 queen 于 2014-5-24 14:19 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')

再补充些:气泡上面是间隙胶,气泡下面是分离胶
一. 电泳的配方如下:1. Low Bis acrylamide(49.5% T, 3% C)
Acylamide 48.0g
Bis 1.5g
Water make up to 100ml
2. High Bis acrylamide (49.5% T, 6% C)
Acrylamide 46.5g
Bi ...

电泳没跑好呢。间隙胶里不应该有条带。
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queen[使用道具]
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原帖由 hold住 于 2014-5-24 14:19 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')


电泳没跑好呢。间隙胶里不应该有条带。

间隙胶里不是应该是大分子的蛋白吗?
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wawa[使用道具]
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我也跑过这样的胶,用三层胶跑效果不好,和你的差不多。后来改用16.5%的tricine胶,只有分离胶和浓缩胶,效果还可以.带不错.你可以试试
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queen[使用道具]
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我也是用的16.5%的,跑过两层胶的,跑不出来,才换成三层胶的,到底是哪里出了问题?焦急中
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hold住[使用道具]
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我跑tricine电泳,所有条带都到了分离胶,间隙胶里没有条带。
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