糖蛋白结构的质谱分析，NSFC化学部分析化学学科优先资助领域,前沿研究，挺有挑战性的，呵呵
刚刚在百度、谷歌搜了一下，貌似有protocols，但具体操作起来挺费脑筋滴，下面是大概浏览的的网络信息，或许有参看作用，哈哈
“糖基化位点的确定，则必须依赖一系列酶切反应的实现来加以证实。一般步骤是：①先将糖蛋白还原烷基化、脱盐，加Glu-c酶切，产物再用内切糖苷酶酶切，含糖肽段峰将出现位移。采用差位酶切法对其进行验证：内切糖苷酶F（Endoglycosidase-F）切断N-糖链中五糖核心区中,两个N-已酰氨基葡萄糖间的内糖苷键，而糖N肽酶F（PNGase-F）切断糖链与天冬酰氨间的糖肽键，两者相差一个N-已酰氨基葡萄糖（194Da）；②凝集素对糖肽的提取：凝集素是一类糖结合蛋白，能专一地识别某一特定结构的单糖或寡糖中特定的糖基序列并与之结合。核糖核酸酶B中的糖链为高甘露糖型，我们选用其特异性吸附凝集素----伴刀豆球蛋白（ConA）对含糖肽段进行提取，并直接进行MALDI-TOF-MS检测，为今后糖肽序列分析及糖链结构分析奠定了基础。 ”
（来源：质谱在糖蛋白研究中的应用
cuturl('http://www.genetong.com/html/biotech/20071013/2493.html') ）
另外，一些参考文献：
Nature Protocols——
Analysis of protein glycosylation by mass spectrometry
cuturl('http://www.natureprotocols.com/2007/06/21/analysis_of_protein_glycosylat.php')
Springer Protocols——
Characterization of Protein Glycosylation by MALDI-TOFMS[url]
cuturl('http://www.springerprotocols.com/Abstract/doi/10.1385/1-59259-045-4:273')[/url]
Structural Characterization of Protein Glycosylation Using HPLC/Electrospray Ionization Mass Spectrometry and Glycosidase Digestion
cuturl('http://www.springerprotocols.com/Abstract/doi/10.1385/0-89603-345-7:255')
Elsevier Review ——
Protein glycosylation analysis by liquid chromatography–mass spectrometry
cuturl('http://www.sciencedirect.com/science?_ob=ArticleURL&_udi=B6X0P-4FFX937-2&_user=10&_rdoc=1&_fmt=&_orig=search&_sort=d&view=c&_acct=C000050221&_version=1&_urlVersion=0&_userid=10&md5=3f654b14264abc68679f5448414b08fe')
Wiley Research Article——
An optimized protocol for nano-LC-MALDI-TOF-MS coupling for the analysis of proteolytic digests of glycoproteins
cuturl('http://www3.interscience.wiley.com/journal/109087454/abstract?CRETRY=1&SRETRY=0')
BioInfoBank Paper——
cuturl('http://lib.bioinfo.pl/pmid:17585300')
呵呵，自己没有做这方面，不过，挺感兴趣的，希望以后能分享LZ的经验，帮您顶一回，嘿嘿
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本帖最后由 aa_tang 于 2008-10-20 19:50 编辑 ]
