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标题:【求助】菌落PCR中的问题

iii_ii[使用道具]
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【求助】菌落PCR中的问题


我是直接在平板上挑菌加入到pcr反应体系中,试剂及反应条件都是没有问题的,我们做的是16S通用引物,结果出现了比marker最大片段1500bp大好多的条带不知道是怎么回事。求高手赐教~~~~


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2015-3-11 17:23
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lgm[使用道具]
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我一般挑出菌落液体培养基要10个小时以后再拿菌液做PCR,直接那菌落出现这种情况个人感觉有可能是挑的菌落中的菌太多,直接跑出来细菌的质粒或者基因组
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qianqin1977[使用道具]
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你挑单克隆把菌摇起来以后,用菌液做PCR试一下
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remenb[使用道具]
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这个有可能是你的引物在菌的基因组中扩增的结果,而不是在你的质类上扩增
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iii_ii[使用道具]
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原帖由 lgm 于 2015-3-11 17:24 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')

我一般挑出菌落液体培养基要10个小时以后再拿菌液做PCR,直接那菌落出现这种情况个人感觉有可能是挑的菌落中的菌太多,直接跑出来细菌的质粒或者基因组 ...

有可能,谢谢啦。不是菌太多久抑制反应了吗?但是我看16S有有P出来的。。。。
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gmjghh[使用道具]
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感觉菌液的纯度有问题,划线以后再挑斑重新检测
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iii_ii[使用道具]
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QUOTE:
原帖由 gmjghh 于 2015-3-11 17:26 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')

感觉菌液的纯度有问题,划线以后再挑斑重新检测

菌不纯?
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gmjghh[使用道具]
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QUOTE:
原帖由 iii_ii 于 2015-3-11 17:26 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')

菌不纯?

感觉有点像,可以试一下
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ququer787[使用道具]
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是不是菌落挑得太多了,把大肠杆菌的染色体跑出来了。
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yayya[使用道具]
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菌量太多了,基因组DNA或者大质粒混在里面,有的PCR酶受抑制但估计还是有活力的,
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