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标题:【求助】双荧光素酶报告基因求助

daod[使用道具]
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【求助】双荧光素酶报告基因求助


最近在做细胞转染实验做双荧光素酶报告基因,实验结果与预测结果相差很大,数据结果比阴性对照还低,阳性对照和阴性对照都正常不可能是转染的问题,难道是预测结果不准确?还请各位大侠不吝赐教,先谢谢大家了!
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wood533[使用道具]
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问题描述的再具体一点吧,比如
1. 你在什么细胞里测试的,转染的是293T细胞,还是其他什么细胞
2. 你做哪个方面的双荧光素酶报告,做启动子?还是做wnt等
3. 你这个实验是关于激活抑或抑制方面的吗?
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daod[使用道具]
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原帖由 wood533 于 2015-3-17 16:37 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')

问题描述的再具体一点吧,比如
1. 你在什么细胞里测试的,转染的是293T细胞,还是其他什么细胞
2. 你做哪个方面的双荧光素酶报告,做启动子?还是做wnt等
3. 你这个实验是关于激活抑或抑制方面的吗? ...

1.我做的是一个关于皮肤毛色的基因,转染的细胞有两种:人皮肤黑素瘤细胞(A375)和293T,转染效率已经用绿色荧光蛋白和阳性对照做过了,转染效率还可以。
2做双荧光是为了检测启动子的活性区域。启动子活性区域是师姐预测的,不知道是激活还是抑制作用,但是就算是抑制也不至于比阴性对照还低吧?
还请指教,谢谢了!
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wood533[使用道具]
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原帖由 daod 于 2015-3-17 16:37 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')

1.我做的是一个关于皮肤毛色的基因,转染的细胞有两种:人皮肤黑素瘤细胞(A375)和293T,转染效率已经用绿色荧光蛋白和阳性对照做过了,转染效率还可以。
2做双荧光是为了检测启动子的活性区域。启动子活性区域是师姐预测的,不 ...

启动子克隆了多长?你能否保证你现克隆到的启动子就一定有活性。你说比阴性对照还低,低多少?
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daod[使用道具]
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原帖由 wood533 于 2015-3-17 16:37 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')

你启动子克隆了多长?你能否保证你现克隆到的启动子就一定有活性。你说比阴性对照还低,低多少?

克隆片段2500多,启动子活性区域是师姐预测的,我现在也在怀疑是不是预测错了。结果比阴性对照稍低一点,相差不是很大。
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wood533[使用道具]
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原帖由 daod 于 2015-3-17 16:38 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')

克隆片段2500多,启动子活性区域是师姐预测的,我现在也在怀疑是不是预测错了。结果比阴性对照稍低一点,相差不是很大。

相差不大,没有统计学意义,就不能说比阴性还低,也有可能是根本你的启动子就没有活性造成的,有阳性对照么?
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daod[使用道具]
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原帖由 wood533 于 2015-3-17 16:38 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')

相差不大,没有统计学意义,就不能说比阴性还低,也有可能是根本你的启动子就没有活性造成的,有阳性对照么?

有阳性对照,很高!阳性对照的比值能达到100左右。
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wood533[使用道具]
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原帖由 daod 于 2015-3-17 16:39 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')

有阳性对照,很高!阳性对照的比值能达到100左右。

那很有可能就是你的目标启动子的问题了,因为你克隆的启动子有没有活性,你也不知道
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jude[使用道具]
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启动子效率如何,如果太小,也会类似于阴性
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TAT[使用道具]
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原帖由 daod 于 2015-3-17 16:38 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')

克隆片段2500多,启动子活性区域是师姐预测的,我现在也在怀疑是不是预测错了。结果比阴性对照稍低一点,相差不是很大。

启动子已经2500bp,应该包含核心启动子区域了,可以再重复做几次,看结果一致不
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