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标题:[未解决]用串联质谱定量碰到的问题

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用串联质谱定量碰到的问题

为以前一直用单四极杆定量,现在要用串联质谱,虽然也查了一些文献,可有有几点非常糊涂,请指教。

(1)串联质谱定量时,用MRM,以其第一级的母离子定量呢,还是以后面产生的碎片峰定量,还是碎片只是定性验证一下看看?
(2)分析步骤是不是:1全扫描;2选择母离子产生碎片峰
在全扫描时其他的碰撞气不启动,直接得到单级的信号?
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串联质谱定量时,是以后面产生的碎片峰(子离子)定量。但是这一子离子是由母离子在碰撞室产生的特征性碎片,所以用MRM定量灵敏度会比用SIM定量好很多。

建立方法的步骤是:用一定溶度的标准品溶液(1-10 ug/mL)Tune化合物的一级质谱条件,找到母离子的最佳质谱条件,然后对母离子进行打碎,优化碰撞能量,得到其特征性的子离子。最后利用该质谱条件和该母离子→子离子对进行定量。

Good luck!
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还有一个问题想请教:你说的子离子定量,我的内标是D代物,打碎后,其特征离子与被测物相同,不会有影响吗?

还有我若想用更多的碎片验证该化合物,为此灵敏度就要下降,还是不会下降很多.?
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你既然用D代物作内标,最好选择一个子离子也和待测物子离子分子量不一样的做定量,否则可能有干扰,因为两者在色谱上一般不分离,而质谱检测器可能会有记忆效应,建议换个结构类似物当内标,或者找一下分子量不同的子离子。

至于你想用更多的碎片验证该化合物,灵敏度肯定要下降。建议定性和定量的实验分开做。
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谢谢!可是文献上报道都是用的D代内标,而且这两主要碎片峰都一样。你说的接近的两峰质核比一样,若没完全分开,我知道在单四极杆中定量是不可能的。若是在三级四极杆质谱中,会不会有点不同? 若还是影响,主要是在线性还是什么别的方面?
还有这个问题一般公司的软件设置,会不会有所处理呢,象DECONVERLUTION啥的?
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没错,一般文献报道都使用D代内标,但他们选择的子离子一般不一样。

就你的情况而言,如果化合物和D代内标的子离子也一样,分析两个的检测会互相干扰,比如你只加化合物而不加氘代内标时,氘代内标也出峰,反之亦有可能,建议你先试试,如果没有这种影响,就最好不过啦!

如有问题,想从软件上入手建议改改扫描时间间隔。
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我已经试过只加内标和只加化合物的情况,似二者没有干扰,很幸运!

现在在做灵敏度时又碰到点问题。

我原来扫描时间是0.4,改为0.3后峰形更难看了,更趴了!这二级质谱在这方面改变会改善一些吗?一般设为啥值呢?扫描间隔多少为最佳?

还有一个TUNE的问题,做之前最好是用该化合物TUNE一下是吧。我看别的公司是用一个三通接上LC、MS、和DIFUSSION PUMP。这个是切换阀进一次样TUNE一下还是怎么回事?不明白啊,不知道VARIANS的仪器哪个咋操作。

还有因为我是先用的仪器上现成的MRM方法,想改一下,先全扫描后选择碎片扫,和先母离子扫后碎片离子全扫。结果楞是不出峰了,不知道是啥原因啊。

另外说一下VARIANSLC-MS-MS,说明书很不详细和清楚,没有象其他公司专门的TUNE界面,改变参数时可很清楚显示离子流的变化,雾化气和干燥气气流压力无法手调。也许是我还不熟的原因,但是觉的不是很好用。
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你一下子又提了很多问题,呵呵!

1)既然化合物和D代内标没有互相干扰,那你很幸运,就用D代内标好了。

2)扫描时间一般设置是0.2s,这和你化合的峰宽有关,一般一个色谱峰需要保证有至少13个数据采集点。

3)关于Tune一般有两种做法:

做法一:用一个三通接上LC、MS、和syringe pump,LC设置相应流速(实际上样品的流速及有机相比例,一般用50%有机相,0.2mL/min (ESI),0.8mL/min (APCI)),syringe pump 注射化合物溶液,一般1-10ug/mL,5-10uL/min,优化各个参数。一般采用该方法。

做法二:切换阀进一次样TUNE一下(flow injection),等你经验丰富了,建议你用该方法,优点:因采用较低浓度样品,基线较低。

4、看了你的描述,我还是不太清楚。作MRM只要你选对母离子和子离子,给予最佳打碎能量,应该没什么问题。

Varian的仪器没用过,他们没有安装培训吗?
建议打电话给他们。
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谢谢!太感谢了!

我是想说MRM出峰还可,换了FULL SCAN--SIR就不出峰了,不知哪出毛病了,我只是改了扫描范围呀,还要变别的吗?

还有用的是别人设好的方法:定量离子一个,定性离子两个,我把定性离子删除后,做定量离子扫描,咦,不出啥峰了?怪,难道除了这个还要改别的吗?

还有TUNE,这VARIANS没有单独的TUNE界面,我找不到它的手动TUNE。AUTOTUNE可用吗?可是这可是和CALIBRATION一起操作,这会影响别的吗?
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作MRM和FULL SCAN是不一样的,有些参数会改变,否则灵敏度会差异很大。

还有,你原来的定量有没有作出来,如果定量作出来了,把定性离子删除后,做定量离子扫描不出峰,应该是仪器有问题,否则方法是不一定能移植的。而且质谱需要经常去TUNE吗?质谱的部分作一类化合物是参数差不多的,作多个化合物本来就是要有取舍的,质量数不偏的话,就不用CALIBRATION,老兄,质谱乱搞会乱套哦!
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