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标题:[未解决]使用BLAST序列比对问题

  [未解决]本主题悬赏 可用分 10  
uytdo[使用道具]
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发表于 2009-1-17 20:19 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

使用BLAST序列比对问题

本人初次做BLAST序列比对，做菌种鉴定，比对结果显示有好几种菌的同源性都在99%以上，请问我应该选那一个?还是应该在做什么处理?
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ngoir[使用道具]
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发表于 2009-1-19 19:39 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
就这两个结果比较而言的话，我认为应该选前面no gaps的，你可以找几十个相似程度最高的，序列都下下来，建个树看看
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santa[使用道具]
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发表于 2009-1-20 23:44 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
用clustalX建立系统发育树，看跟哪个菌种处于最小分支
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