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标题:【讨论帖】microRNA内参,u6,u6a,u6b,到底如何选择

园丁##[使用道具]
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【讨论帖】microRNA内参,u6,u6a,u6b,到底如何选择

我的做法是先逆转录再荧光定量pcr!
逆转录使用特异性引物(u6的反向引物)。
u6,also as know RNU6A,RNU6B,分别对应 RNU6-1,RNU6-2,
U6 F CTCGCTTCGGCAGCACA
U6 R AACGCTTCACGAATTTGCGT
这个引物是在google学术搜索里面检索出来文献最多的,有多篇cancer reserach高影响因子使用,且经丁香园内朋友使用,反应很好!
在生工合成的,今天pcr结果非常好!U6的ct 13.1左右。
另外,多谢园友提醒,这些u6都是用于人的。不清楚,也没有验证是否可以用于老鼠!
希望能够给大家一点帮助。
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园丁##[使用道具]
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后记:U6 F CTCGCTTCGGCAGCACAU6 R AACGCTTCACGAATTTGCGT这个引物是在google学术搜索里面检索出来文献最多的,有多篇cancer reserach高影响因子使用,所以在没有人回答的情况下,选择了这个。在生工合成的,今天pcr结果非常好!U6的ct 13.1左右。不知道别的U6引物实验结果怎么样,但是我可以证明,这个用着很好!希望能够给大家一点帮助。对你有帮助的话,请投票支持!
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园丁##[使用道具]
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U6 F CTCGCTTCGGCAGCACA
U6 R AACGCTTCACGAATTTGCGT
这个引物是在google学术搜索里面检索出来文献最多的,有多篇cancer reserach高影响因子使用,所以在没有人回答的情况下,选择了这个。
在生工合成的,今天pcr结果非常好!U6的ct 13.1左右。
不知道别的U6引物实验结果怎么样,但是我可以证明,这个用着很好!
希望能够给大家一点帮助。
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JK.jon[使用道具]
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我刚开始做micro-rna,也不知用什么引物?本来打算直接买U6的试剂盒,可是挺贵的,
谢谢楼主的提供,先合成试试.谢谢了,那请问楼主是用的TAKARA的RT-PCR试剂盒吗?
谢谢了,急需!
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S6044[使用道具]
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请问一下楼主:你的U6是人的还是什么物种的?包括了探针序列吗?
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chengjie79[使用道具]
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楼主好,我现在也要准备做血浆的MICROrna,不知道 楼主用什么方法提的microRNA,用的什么试剂盒,推荐一下,谢谢!
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shenkunjie[使用道具]
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7
 
楼主U6有RT引物吗?
需要合成茎环RT引物吗?
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园丁##[使用道具]
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QUOTE:
原帖由 shenkunjie 于 2015-6-1 15:22 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
楼主U6有RT引物吗?
需要合成茎环RT引物吗?

u6的rt引物,就是pcr时的反向引物。
不需要颈环的!
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园丁##[使用道具]
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逆转录时不用oligo dt 和 随机6碱基引物,改用U6的反向引物U6 R AACGCTTCACGAATTTGCGT。
就是进行特异性逆转录!
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am10[使用道具]
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我用的是u6的内参,但是RT和pcr的盒子都用的是AB家的,还有想问,如果是做血浆的microRNA和做血清的,有什么差别呢?
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