PCR仪

现在每种组织基本都找到了最适的内参，何必一直用actin。

这个应该也是相对的。内参选择可能需要根据具体的研究情况来选择，不能人云亦云。
作为内参的一般都是选管家基因或蛋白， 理由是认为他们是恒定表达的，不会因为条件的变化而变化。
但现在越来越多的研究证明这些所谓的管家蛋白或基因并不是恒定的，在某些条件下是存在改变的。
楼主提供的文献可能也只是说actin在某些情况下不适合，而非绝对不适合。【未看全文，仅属推测】
在WB实验中，也有类似的报道“
-Actin is not a reliable loading control in Western blot analysis. Electrophoresis 2006, 27, 2844–2845”。

所以，在PCR或WB时，在选内参时，最好能提前仔细分析下待选内参是否适合你的实验情况。尽量避免可能的麻烦。而且分析选择的理由也能为你日后投稿的解释理由（如果有碰到纠结这个问题的reviewer）

提供一些文章的篇名吧，省的花叮当。差不多大器官都有了。

1. Equivalence test in quantitative reverse transcription polymerase chain reaction-- confirmation of reference genes suitable for normalization

2. Identification of suitable reference genes for gene expression studies of human serous ovarian cancer by real-time polymerase chain reaction

3. In search of suitable reference genes for gene expression studies of human renal cell carcinoma by real-time PCR

4. Both beta-actin and GAPDH are useful reference genes for normalization of quantitative RT-PCR in human FFPE tissue samples of prostate cancer

5. Identification of genes for normalization of real-time RT-PCR data in breast carcinomas

6. Gene expression studies in prostate cancer tissue-- which reference gene should be selected for normalization

7. Identification of endogenous reference genes for qRT-PCR analysis in normal matched breast tumor tissues

8. GUS and PMM1 as suitable reference genes for gene expression analysis in the liver tissue of patients with chronic hepatitis.

9. Identification and validation of suitable endogenous reference genes for gene expression studies of human bladder cancer.

10. Identification of importin 8 (IPO8) as the most accurate reference gene for the clinicopathological analysis of lung specimens.

11.Identification of valid reference genes for gene expression studies of human stomach cancer by reverse transcription-qPCR.

12. Identification of valid reference genes for the normalization of RT qPCR gene expression data in human brain tissue.

其实GAPDH应该还是可以的。

因各个模型，各个组织，而异，不可一概而论

我在投第一篇SCI的时候就选择的一个不常用的看家基因作为内参基因，结果在审稿的时候就遇到了这个问题。当时的审稿人问到为什么不选用常用的beta-actin或者GAPDH，有什么理由？同时给了一些关于怀疑内参基因稳定的一些文献，认真学习后觉得很有道理！

不过老天有眼，当时我选的新的内参表现很好，而且在做实验的过程中也注意到了好多细节，所以用real-time PCR做出来的每一组的内参基因的CT值偏差很小，在回复意见的时候将这张图展示给了审稿人，就OK了。说实话，是虚惊了一场。

不过，收益最大的是，当看到审稿人的意见和提供的文献后，马上进行了适合我试验的内参基因的帅选，在前几天已这个为题，收获了第二篇SCI（2011年7月8日accepted）！~！！

算是收获蛮大的

cuturl('http://www.gene-quantification.de/hkg.html')
check this website. there are several softwares helping you to choose housekeeping genes. i used geNorm before but don't think give a lot of helps....

贴一篇中文的供参考：
GAPDH mRNA在不同癌组织(包括肺癌、乳腺癌、肾细胞癌等)中的表达升高,在不同个体间、怀孕期间以及细胞周期的不同阶段等变化很大...在各种因素(例如低氧、胰岛素、地塞米松、丝裂原、表皮生长因子等)刺激下,培养细胞GAPDH mRNA的表达水平也不同。
当细胞向恶性转化时,β-actin mRNA 的表达水平增加;而假基因的的存在也可干扰β-actin的检测。
应用2个或多个内参基因进行定量优于单个:所有的内参基因在确定的条件下有鉴别不同调节的潜能。在一组给定的标本或实验条件中,平行测定2个或以上看家基因的量有助于发现任何系统偏差。因此,许多学者建议:在应用FQ RT-PCR进行基因转录分析中,选择一个以上的内参基因用作内参可得到更可靠的结果。