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标题:熔解曲线出现倒峰 [转自 丁香园论坛]

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熔解曲线出现倒峰 [转自 丁香园论坛]


熔解曲线出现倒峰 [转自 丁香园论坛]


大家好,我做realtime PCR,我的目的产物大小为260bp,PCR反应的条件为:95度60秒,95度15秒,60度15秒,72度45秒,共40个循环。实验结果很怪:熔解曲线出现一个倒峰(见附件)。我不知是不是片段有点长,72度延伸时间太短所致。


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的确比较奇怪。你倒是不妨先将PCR产物拿来跑个电泳,看是否有正常的扩增产物~~~~~~~~~

扩增条件还可以,解链时间还行,应该能够解链充分的。
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跑电泳了,有目的片段,虽然条带非常微弱。
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是不是你realtime仪器程序设定有问题,理论上不应该出现这种情况。
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但是内参(GAPDH)的熔解曲线很正常(下图)啊
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如下~~~~~~~~~~~~~~~~:


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1. 目的产物的溶解温度不详,建议你将溶解温度提高到99度来做,很有可能在90多度出现正常的解链峰。

2.目的产物的纵坐标跨度为0.01~0.08,相对于内参基因的0~0.5来讲这个范围其实是比较小的,在这种“放大”溶解曲线中很有可能出现怪异的曲线。如果将纵坐标变成0~0.5,这个倒着的小峰可能看起来就不那么明显了。

3.正如你说的,目的产物的量很少,这有可能是导致纵坐标跨度范围小的原因。建议你增加模板的量,减少引物的使用量(0.2uM each,可以在一定程度上增加PCR反应的特异性),或者换一种扩增效率稍微高一点的Mix试试,可能会好一点。
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