小中大4、引物是从国外文献上拷贝下来的，国内有人在其他组织中做过MSP，引物序列和国外文献一样。引物是由上海生工合成的，溶解是用的TE缓冲液，然后分装，放在-20度保存。
5、查找原因时，我将第一步dna提取得到的dna溶液，每个样本取了6微升，用0.8%凝胶电泳跑电泳，结果maker条带依然很好，找了个老师看了一下，他说其他区域什么也没有。（是不是dna就没有提取出来？）
6、整个实验过程没有严格消毒。
于是这周我开始从DNA提取步骤开始查找原因，在第一步DNA抽提过程中，我发觉放入蛋白酶K后56度水浴三小时后，液体还是有絮状浑浊，似乎消化的很慢，后来第二次实验我加入了说明书上所写的两倍多的蛋白酶K的量，56度水浴过夜，第二天还是有一些絮状混浊，当然比第一次少一点，我就没管它，继续进行下面离心柱抽提dna，然后我把这两次提取的DNA,直接用0.8%的凝胶电泳跑电泳，紫外光下观察发现样品1出现的是从注入孔开始一长溜暗条带，而不是在某一位置有一个亮条带，样品2出现的是从注入孔开始一窄的纵向亮条带。我找了一个老师看，她说出现样品1的图可能因为dna的量太少，而且都是碎裂的DNA，各个长度的都有，出现样品2的图可能是注入样品时点状注入没有铺开，而且她说这样的DNA,如果勉强进行下面的甲基化修饰和PCR,很难出结果。
我想请教一下为什么抽提出这样的DNA，是不是石蜡标本的dna不好提取？还是本身就已经降解很多？还能进行下面的甲基化修饰和甲基化PCR吗？
