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标题:【求助】引物稀释

胖小妮子[使用道具]
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【求助】引物稀释

【求助】引物稀释 [转自 丁香园论坛]


各位高手请教一个小问题,新引物如何稀释?谢谢 !!!!!!!!!!
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wawa[使用道具]
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记得管上会写是几个OD吧,还有就是几个nmol,我要是没记错,应该是这样的,如果管子上写3.9nmol,那么你就可以加39μl的水,就变成了100μmol/l的储存液了,然后使用的时候再稀释20倍就变成5μmol/l,就可以使用了啊
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大虾米[使用道具]
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举例如下:根据你合成报告单上的说明(生工)附注中所示每OD的引物加XXul的缓冲液配成100uM的储存液。假如我的合成报告单上附注,每OD的引物加55ul的缓冲液配成100uM的储存液,而我的PCR体系要求引物浓度是2.5uM,那我先稀释4倍,就是加220ul的水到干粉(稀释前要离心,使干粉到管底),然后再每次用时,再拿其中的一部分,分装稀释10倍就可以了

注意引物最好不要多次冻溶,这样易降解。如果试验中发现引物效率降低,既以前p的很亮,现在不亮了,要重新配置引物,减少实验耽误时间。如果发现引物二聚体明显,可以考虑在高温条件下把引物煮一下!
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爱哭鬼[使用道具]
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回答很全面
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不懂[使用道具]
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请问缓冲液用超纯水还是用DEPC水?多谢了!
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QUOTE:
原帖由 不懂 于 2011-8-23 17:21 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
请问缓冲液用超纯水还是用DEPC水?多谢了!  

您所说的缓冲液是指什么?是指溶解引物的吧?一般都是用超纯水或者TEbuffer来溶解,不要用DEPC水,DEPC水呈弱酸性,oligoDNA容易在酸性溶液中降解,不利于保存,我们都是用灭菌的双蒸水溶解,溶解前干粉离心,让干粉沉在管底,加溶液后振荡混匀,保存一年都还可以使用,使用前充分溶解,关键是双蒸水不要偏酸和不要反复冻融,最好将大管分装成几管使用。
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不懂[使用道具]
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多谢了,对,我说的缓冲液就是溶解引物的,我用的是超纯水,后来想想DEPC不错,因为DEPC是消除RNA酶的,如果做RT的话,引物里边如果含有RNA酶就不行了,超纯水是否经过RNA酶处理也不能保证,所以我认为DEPC更好!请多多指教!个人意见!呵呵!  
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HOT兔[使用道具]
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不能用DEPC水,因为PCR反应是在弱碱性条件下进行的。
我建议先用PH=8.0的TE溶解成100uM的母液,用时在根据需要稀释成5-10UM。
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冷太阳[使用道具]
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我也来说两句。以下的问答转自上海生工的技术支持内容:
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2.怎样溶解引物?
我们的的合成报告单给出了每OD引物稀释为100μmoL/L(即100pmol/ul)浓度的加水量,您可以根椐您的实验需要加入适量的无核酸酶的双蒸水(PH>6.0)或TE缓冲液(PH 7.5-8.0),开启瓶盖溶解之前最好在3000-4000转/分钟 的转速下离心1分钟,防止开盖时引物散失。
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其中所说的“无核酸酶的双蒸水(PH>6.0)”我个人的意见是:它就是DEPC处理水(经高压后就无RNase酶)。但PH值是否>6.0我还没来的及检测。不知大家对于这个问题有何看法?
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阿拉蕾[使用道具]
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融解引物的话使用超纯水就足够了(按照我们实验室的习惯,将超纯水装瓶子里灭菌后使用),不需要用DEPC水。因为DNase的稳定性远不如RNase,只要高温处理就可以灭活。
当然如果引物是反转录中cDNA第一链合成时使用,或者一步法RT-PCR就需要使用DEPC水。不过如果cDNA第一链已经合成了,用这个cDNA作为引物跑PCR的引物不需要用DEPC水,因为此时已经不需要担心RNA降解了。

对于一般引物融解方法,个人比较同意楼上 岸上的鱼 战友的说法。DNA在酸性条件不稳定,引物降解对PCR效率影响很大的。
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