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标题:求助:如何从血浆中提取高质量的miRNA?

羊咩咩[使用道具]
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求助:如何从血浆中提取高质量的miRNA?

求助:如何从血浆中提取高质量的miRNA?[转自 丁香园论坛]


我想从血浆中提取总RNA,后续试验是做对其中的miRNA作荧光定量PCR。但用了trizol 和 miRVANA paris kit以及 miRVANA iso kit(Ambion) (Ambion) 两种试剂盒,提出来的RNA的质量都不太好。260/280在1.2以下,有一次竟然还出现负数。想请教各位有什么好办法?***赐教。不胜感激。
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嘉年华[使用道具]
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血浆中的miRNA量比较少,不好提。
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我用SDS预沉淀和加热预处理两种方法提外周血中miRNA,后面做荧光定量PCR,但提出的RNA浓度都很低呀,而且260/280的徘徊在1.3,也提高不上去。具体步骤如下:

SDS预处理:500ul血浆样本与500ul10%SDS进行1:1混合,4度孵育1h后提取RNA.

加热预处理:500ul血浆,75度加热5-10min,42度温育1h后提取RNA。

提取RNA的步骤:向处理过的样本中加入等体积的Trizol,混匀,室温静置5min;加入1/5体积氯仿,剧烈震荡,静置2min;4°C 12000g离心15min;取上清,加入等体积的异丙醇,混匀,-20°C沉淀过夜,次日4°C 12000g离心10min;弃上清,1ml 75%乙醇洗涤沉淀,4°C 12000g离心15min;弃上清,沉淀晾干后,20ul的DEPC水溶解沉淀,测浓度,便得出以上的结果。

重复三次了,结果都不理想,请高手指教!!!
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羊咩咩[使用道具]
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QUOTE:
原帖由 嘉年华 于 2011-8-31 10:46 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
血浆中的miRNA量比较少,不好提。

我知道不好提,所以咨询一下各位怎么提  
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1.3拍什么照样做荧光定量就可以了,我1.0做的还很好呢
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QUOTE:
原帖由 小困 于 2011-8-31 10:47 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
我用SDS预沉淀和加热预处理两种方法提外周血中miRNA,后面做荧光定量PCR,但提出的RNA浓度都很低呀,而且260/280的徘徊在1.3,也提高不上去。具体步骤如下:

SDS预处理:500ul血浆样本与500ul10%SDS进行1:1混合,4度孵育1h后提取 ...

不用沉淀过夜吧好像30分钟就可以了,改为80%的乙醇试试好的话回复我一个
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Biotekepeter[使用道具]
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[ 本帖最后由 Biotekepeter 于 2013-3-27 10:28 编辑 ]
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