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标题:请教有关半定量RT-PCR问题

jude[使用道具]
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请教有关半定量RT-PCR问题

请教有关半定量RT-PCR问题 [转载]


我听别人说有用DNA marker做半定量RT-PCR用,我想请教几个问题:
1.DNA marker的作用和beta-actin是否一样?这两者能否分别单独进行本定量?
2.如果这两者都能单独作半定量,哪一种特异性更高一点?哪一种更常用一些?

请各位高手不吝赐教!十分感谢!
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阿拉蕾[使用道具]
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2
 
我认为这是内标和外标的关系!

DNA marker是可用来半定量,算外标准。

而如果你由于取材、逆转录或PCR产生的差异只有内标准可以排除。

例如:逆转录的产物做beta-actin和目的基因的PCR反应,反应体系相同只是引物不同,可以排除扩增的差异。

请大家指正!
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小妖儿[使用道具]
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在这里我再提供两个建议。
1. 如有可能尽量做同管扩增,即内参照和你的目的基因在一个体系中同时扩增,这样的数据则更有说服力。
2. 做半定量PCR一定要先摸一下PCR循环数,因为PCR产物的量一开始是一个接近直线的上升期,到了一定循环后,就为一个平台期。而坐半定量一定要把循环数控制在平台期之前,否则没有意义。这一点非常重要。
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小妖儿[使用道具]
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在这里我再提供两个建议。
1. 如有可能尽量做同管扩增,即内参照和你的目的基因在一个体系中同时扩增,这样的数据则更有说服力。
2. 做半定量PCR一定要先摸一下PCR循环数,因为PCR产物的量一开始是一个接近直线的上升期,到了一定循环后,就为一个平台期。而坐半定量一定要把循环数控制在平台期之前,否则没有意义。这一点非常重要。
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jude[使用道具]
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谢谢两位朋友的热心帮助!我是临床专业,最这些东西不是太懂,能得到大家的帮助十分高兴,我马上就要做实验了,如果实验中有问题,还要向大家请教!
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麻瓜[使用道具]
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我想请教如何确定合适的循环数使半定量RT-PCR的扩增产物递增在平台期以前呢?谢谢
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小妖儿[使用道具]
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7
 
你做PCR体系时,要做的一致。然后分别跑不同的循环数,譬如从23-37个循环。然后扫胶,根据靶基因和内参照的比值来做一个曲线。从这个曲线中可以看到到了一定循环数时,就到了一个平台期了。我们要选择这个平台期之前的循环数来做半定量PCR。
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